Table showing results for November 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7RSo	24676	2024-11-20	2021-08-11	4.1	4.34	4.12	4.3	0.023	1.85	0.0	0.16	14.25	0.01	2.407	0.84	0.15	1.4	98.6	0.0	0.79	0.75	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20568	2355	54	0	144	0	0	logfile
✘	7P8N	13254	2024-11-20	2021-07-23	2.8	2.25	2.70	2.4	0.003	0.51	0.0	0.04	14.49	0.00	1.936	4.40	0.00	3.8	96.1	0.1	0.45	0.68	0.80	3.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21429	2681	18	0	23	356	0	logfile
✘	7RHR	24467	2024-11-15	2021-07-18	3.0	3.18	—	3.1	0.006	0.84	0.0	0.05	11.89	0.01	2.131	9.63	0.00	5.1	94.8	0.1	-0.44	0.68	0.81	3.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7820	974	3	0	7	0	0	logfile
✘	7FD8	31536	2024-11-17	2021-07-16	3.8	3.98	3.73	3.6	0.008	1.40	2.0	0.11	13.89	0.00	2.025	5.06	0.61	8.6	91.3	0.1	-2.25	0.73	0.82	2.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12152	1528	4	0	6	0	0	logfile
✘	7RFi	24443	2024-11-19	2021-07-14	2.6	2.65	—	2.6	0.014	1.86	8.0	0.11	19.32	0.01	2.335	3.53	1.61	4.0	95.6	0.4	-1.71	0.67	0.87	5.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	52194	3376	16	0	32	0	25698	logfile
✘	7RBU	24402	2024-11-14	2021-07-06	3.7	2.38	—	2.2	0.006	0.80	0.0	0.05	12.81	0.00	2.167	6.95	0.00	9.1	90.7	0.2	-2.50	0.74	0.77	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4107	510	6	0	7	0	0	logfile
✘	7F9W	31499	2024-11-14	2021-07-05	3.2	3.72	—	3.6	0.005	0.68	0.0	0.04	12.99	0.00	2.114	9.28	0.63	4.5	95.5	0.0	0.24	0.76	0.80	3.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4217	547	3	0	0	0	0	logfile
✘	7RB9	24400	2024-11-17	2021-07-05	3.76	4.01	3.83	3.9	0.003	0.57	0.0	0.04	14.69	0.00	2.228	9.31	0.00	3.2	96.8	0.0	0.60	0.59	0.85	1.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14193	1786	7	0	6	0	0	logfile
✘	7RAS	24385	2024-11-19	2021-07-02	3.64	4.18	—	4.1	0.010	1.33	0.0	0.05	11.93	0.01	2.283	4.29	1.11	6.3	93.2	0.5	-6.09	0.67	0.82	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20000	2440	8	0	8	0	0	logfile
✘	7P1H	13159	2024-11-17	2021-07-01	3.9	4.12	—	3.9	0.005	1.01	0.0	0.05	14.38	0.01	2.016	12.38	0.00	5.7	94.3	0.0	-1.60	0.81	0.60	0.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13966	898	4	0	2	0	6926	logfile
✘	7P14	13155	2024-11-14	2021-07-01	3.66	3.82	3.50	3.8	0.004	0.63	0.0	0.04	19.09	0.00	2.295	7.45	0.00	2.7	97.3	0.0	1.11	0.60	0.78	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3796	454	3	0	3	0	0	logfile
✘	7oZo	13130	2024-11-20	2021-06-28	3.8	4.06	3.82	3.9	0.002	0.39	0.0	0.04	14.07	0.00	1.993	4.62	0.00	2.1	97.9	0.0	1.21	0.79	0.71	0.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	54330	6774	32	0	10	0	0	logfile
✘	7oZP	13131	2024-11-20	2021-06-28	3.8	4.17	3.83	4.0	0.002	0.39	0.0	0.04	14.04	0.00	1.969	4.71	0.00	2.1	97.9	0.0	1.24	0.79	0.71	0.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	54330	6774	32	0	10	0	0	logfile
✘	7oZU	13135	2024-11-15	2021-06-28	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8408	991	6	22	2	0	0	logfile
✘	7oZV	13138	2024-11-15	2021-06-28	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8409	991	6	22	2	0	0	logfile
✘	7F73	31484	2024-11-14	2021-06-27	4.0	4.29	3.95	4.3	0.007	1.07	0.0	0.06	15.26	0.00	2.247	11.96	4.10	3.1	96.9	0.0	0.17	0.57	0.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4934	586	2	0	0	0	0	logfile
✘	7R77	24294	2024-11-18	2021-06-24	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14980	1830	4	25	5	0	0	logfile
✘	7R76	24292	2024-11-17	2021-06-24	3.2	3.43	—	3.3	0.008	1.02	1.0	0.06	14.99	0.01	1.995	12.70	0.38	9.0	91.0	0.0	-2.71	0.74	0.79	2.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14500	1834	2	0	5	0	0	logfile
✘	7R78	24295	2024-11-18	2021-06-24	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15238	1881	5	18	7	0	0	logfile
✘	7F62	31470	2024-11-14	2021-06-24	3.6	4.33	—	4.1	0.003	0.65	0.0	0.04	13.21	0.00	1.925	19.73	1.38	8.1	91.6	0.2	-2.76	0.66	0.62	0.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3321	427	3	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 25 of 38
• next →