Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7Z17	14443	2024-02-23	2022-02-24	2.57	2.96	2.68	2.9	0.005	0.53	0.0	0.04	10.98	0.00	1.726	6.80	0.84	2.9	97.1	0.0	1.01	0.72	0.77	3.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	37592	2432	14	0	5	0	18669	logfile
✘	7YZP	14393	2024-02-17	2022-02-21	4.0	4.15	4.02	4.0	0.003	0.62	1.0	0.04	17.72	0.00	1.593	8.32	0.00	4.2	95.8	0.0	0.73	0.83	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14107	1633	9	59	8	0	0	logfile
✘	7X01	32914	2024-02-23	2022-02-20	2.62	2.72	—	2.7	0.007	0.69	0.0	0.05	14.01	0.01	2.242	3.31	0.00	3.7	96.3	0.0	-0.67	0.73	0.84	3.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	39732	5052	24	0	24	0	0	logfile
✘	7WZN	32907	2024-02-20	2022-02-18	4.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27190	3726	30	0	211	0	0	logfile
✘	7WZ3	32903	2024-02-14	2022-02-16	4.1	3.52	—	3.4	0.003	0.58	0.0	0.04	11.64	0.00	2.022	2.41	0.06	2.8	97.2	0.0	-4.27	0.62	0.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	58551	7652	22	0	6	0	0	logfile
✘	7WYZ	32899	2024-02-18	2022-02-16	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22682	2654	22	0	78	4	0	logfile
✘	7WYi	32892	2024-02-19	2022-02-16	3.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25007	3631	28	0	171	0	0	logfile
✘	7WY8	32887	2024-02-13	2022-02-15	2.83	2.24	—	2.0	0.007	0.81	0.0	0.05	12.03	0.01	2.220	1.00	0.00	4.1	95.9	0.0	-0.39	0.76	0.76	3.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8049	1015	5	0	0	0	0	logfile
✘	7WWU	32873	2024-02-18	2022-02-14	3.5	3.60	—	3.5	0.003	0.60	0.0	0.04	15.51	0.00	2.159	9.10	0.11	8.8	91.2	0.0	-1.71	0.74	0.78	2.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18864	2400	10	50	0	0	0	logfile
✘	7TYR	26192	2024-02-24	2022-02-14	3.33	3.67	3.41	3.5	0.004	0.76	0.0	0.05	19.61	0.00	2.171	8.15	2.70	5.1	94.7	0.2	0.19	0.79	0.79	1.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31610	3957	2	0	0	0	0	logfile
✘	7R5M	14331	2024-02-15	2022-02-11	3.3	3.09	3.20	3.2	0.006	0.94	0.0	0.06	14.64	0.00	2.411	1.26	0.80	4.6	95.4	0.0	-0.79	0.70	0.80	2.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11295	1491	9	0	0	0	0	logfile
✘	7WVW	32860	2024-02-13	2022-02-11	3.1	3.26	—	3.2	0.002	0.50	0.0	0.04	13.51	0.00	2.197	9.35	0.00	1.5	98.5	0.0	0.78	0.62	0.77	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7169	924	5	0	0	0	0	logfile
✘	7WUH	32832	2024-02-22	2022-02-08	4.7	4.83	—	4.7	0.005	0.93	0.0	0.06	17.31	0.01	2.038	27.65	0.13	12.1	87.7	0.2	-3.10	0.69	0.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35569	4431	37	0	98	0	0	logfile
✘	7WTU	32801	2024-02-19	2022-02-05	3.0	2.94	—	2.8	0.006	0.90	0.0	0.05	21.50	0.01	1.590	5.93	0.86	4.3	95.6	0.0	-1.34	0.70	0.65	2.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	81215	5957	35	1575	1	0	0	logfile
✘	7WTM	32791	2024-02-24	2022-02-05	3.5	3.32	—	3.2	0.006	0.89	0.0	0.05	21.84	0.01	2.110	6.36	0.00	7.6	92.4	0.1	-1.86	0.80	0.78	2.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	44623	2651	18	1106	1	0	0	logfile
✘	7WTG	32785	2024-02-13	2022-02-04	3.8	3.93	—	3.9	0.006	1.20	0.0	0.07	14.44	0.01	2.297	4.61	0.00	9.1	90.9	0.0	-2.94	0.67	0.73	2.60	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3318	425	3	0	0	0	0	logfile
✘	7WT7	32770	2024-02-20	2022-02-04	3.4	3.87	—	3.8	0.005	0.92	15.0	0.06	14.36	0.01	2.132	9.81	0.91	7.1	92.6	0.3	-1.79	0.78	0.77	1.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	28322	3523	12	0	50	0	0	logfile
✘	7R1D	14239	2024-02-13	2022-02-02	3.5	3.51	—	3.5	0.005	0.80	0.0	0.05	13.61	0.01	2.097	17.88	0.00	7.1	92.9	0.0	-1.31	0.77	0.79	2.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5183	653	3	0	0	0	0	logfile
✘	7WSF	32756	2024-02-16	2022-01-29	2.87	3.08	—	3.1	0.003	0.44	0.0	0.04	11.23	0.00	2.016	6.14	3.87	2.7	97.3	0.0	-0.12	0.72	0.81	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7170	879	3	0	1	0	0	logfile
✘	7WSi	32759	2024-02-13	2022-01-29	3.32	3.90	—	3.8	0.003	0.67	0.0	0.04	12.25	0.00	2.122	8.82	0.00	7.9	92.1	0.0	-0.23	0.66	0.77	1.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5701	743	3	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 18 of 46
• next →