Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7WRL	32732	2024-02-13	2022-01-27	3.51	3.69	—	3.6	0.006	1.03	0.0	0.06	14.71	0.01	2.289	5.84	0.00	13.4	86.6	0.0	-4.19	0.64	0.78	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3251	419	3	0	0	0	0	logfile
✘	7TQV	26073	2024-02-17	2022-01-27	3.43	3.72	—	3.7	0.002	0.38	0.0	0.04	10.87	0.00	2.162	5.00	0.82	3.8	96.2	0.0	-0.34	0.68	0.69	2.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17792	2083	8	66	0	0	0	logfile
✘	7QWQ	14191	2024-02-23	2022-01-25	2.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	143809	7312	59	3936	158	0	0	logfile
✘	7ToP	26034	2024-02-17	2022-01-24	2.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7TP2	26046	2024-02-19	2022-01-24	3.72	4.22	—	3.7	0.014	1.76	6.0	0.10	13.20	0.01	2.529	0.21	1.32	7.2	92.4	0.4	-1.34	0.85	0.84	2.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24663	3047	20	0	61	0	0	logfile
✘	7Too	26033	2024-02-17	2022-01-24	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7ToS	26037	2024-02-24	2022-01-24	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7TM0	25992	2024-02-20	2022-01-19	3.1	3.24	3.21	3.2	0.010	1.37	0.0	0.08	8.59	0.01	2.264	1.47	0.17	2.4	97.6	0.0	0.62	0.73	0.76	3.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27963	4401	19	0	52	0	0	logfile
✘	7QV7	14169	2024-02-24	2022-01-19	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	41236	5276	32	0	58	0	0	logfile
✘	7TLB	25986	2024-02-18	2022-01-18	3.06	3.26	—	3.2	0.012	1.74	1.0	0.09	13.14	0.01	2.531	0.11	0.82	5.3	94.7	0.1	-1.00	0.54	0.56	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22806	2916	3	0	0	0	0	logfile
✘	7TLD	25988	2024-02-18	2022-01-18	2.89	3.35	—	3.3	0.013	1.80	0.0	0.09	13.31	0.01	2.524	0.07	0.94	5.2	94.6	0.2	-1.25	0.33	0.48	3.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22812	2916	3	0	0	0	0	logfile
✘	7TJ9	25920	2024-02-15	2022-01-14	2.9	3.19	—	3.1	0.017	1.02	0.0	0.06	18.48	0.01	2.167	6.06	0.09	5.0	95.0	0.0	0.12	0.56	0.82	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10975	1273	5	0	24	0	0	logfile
✘	7TES	25851	2024-02-21	2022-01-05	4.7	8.44	4.80	4.3	0.004	0.92	0.0	0.05	14.89	0.01	2.261	9.08	1.27	8.9	90.9	0.3	-4.01	0.82	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31306	3986	8	0	0	0	0	logfile
✘	7QPD	14119	2024-02-15	2022-01-03	3.73	3.98	—	3.9	0.005	0.81	0.0	0.05	12.54	0.00	2.225	9.51	0.09	4.9	95.0	0.1	-1.20	0.80	0.76	2.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11521	1544	7	0	10	0	0	logfile
✘	7QPA	14116	2024-02-15	2022-01-03	3.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1.43	—	—	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10814	654	6	0	4	64	5540	logfile
✘	7QPC	14117	2024-02-15	2022-01-03	3.44	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1.61	—	—	1.03	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10830	654	6	0	4	62	5540	logfile
✘	7WGV	32490	2024-02-20	2021-12-29	3.2	3.63	—	3.6	0.017	1.29	0.0	0.05	14.42	0.00	2.151	5.03	0.00	3.2	96.8	0.0	-0.59	0.79	0.83	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26931	3309	21	0	69	0	0	logfile
✘	7WGX	32491	2024-02-19	2021-12-29	3.5	3.82	—	3.8	0.017	1.20	0.0	0.05	13.51	0.00	2.256	4.67	0.00	3.9	95.6	0.5	-0.06	0.79	0.83	2.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25629	3165	21	0	60	0	0	logfile
✘	7WG5	32477	2024-02-14	2021-12-28	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	112687	11759	92	0	545	0	0	logfile
✘	7WFE	32463	2024-02-22	2021-12-26	3.25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35123	3216	30	0	205	0	0	logfile

• ← previous
• Page 19 of 46
• next →