Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7P5Y	13208	2024-02-24	2021-07-15	3.29	2.97	3.19	3.1	0.002	0.49	0.0	0.04	11.33	0.00	2.158	10.43	2.64	3.5	96.5	0.0	-0.32	0.72	0.72	1.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	41106	5028	12	0	0	0	0	logfile
✘	7RGQ	24454	2024-02-14	2021-07-15	3.9	3.65	—	3.7	0.013	1.98	9.0	0.09	19.50	0.01	2.357	2.12	2.74	6.9	92.4	0.7	-1.98	0.56	0.81	3.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	59832	3848	16	0	40	0	29544	logfile
✘	7RBV	24403	2024-02-21	2021-07-06	3.6	3.85	—	3.8	0.005	0.79	0.0	0.05	19.65	0.00	2.167	6.90	0.19	8.0	91.8	0.2	-1.94	0.72	0.74	2.20	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30431	3718	40	0	111	0	0	logfile
✘	7RBU	24402	2024-02-13	2021-07-06	3.7	2.38	—	2.2	0.006	0.80	0.0	0.05	12.81	0.00	2.167	6.95	0.00	9.1	90.7	0.2	-2.50	0.74	0.77	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4107	510	6	0	7	0	0	logfile
✘	7F9o	31498	2024-02-15	2021-07-04	4.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	106329	11553	82	0	461	0	0	logfile
✘	7P00	13140	2024-02-14	2021-06-29	2.71	2.90	—	3.0	0.012	1.68	8.0	0.11	12.35	0.01	2.236	4.97	0.81	3.4	96.6	0.0	-0.50	0.68	0.82	3.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9110	1144	7	0	2	0	0	logfile
✘	7RA3	24334	2024-02-15	2021-06-29	3.24	3.47	—	3.3	0.005	0.91	0.0	0.05	13.68	0.00	2.074	6.99	0.35	7.1	92.9	0.0	-1.87	0.69	0.80	2.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10802	1381	7	0	0	0	0	logfile
✘	7oZV	13138	2024-02-14	2021-06-28	3.2	3.08	3.16	3.3	0.007	0.58	0.0	0.04	15.02	0.01	2.202	8.41	0.00	2.6	97.4	0.0	-0.22	0.64	0.79	3.09	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8409	991	6	22	2	0	0	logfile
✘	7R88	24311	2024-02-15	2021-06-26	3.5	3.76	—	3.7	0.002	0.45	0.0	0.04	12.49	0.00	2.274	5.35	1.02	3.5	96.5	0.0	-1.50	0.69	0.85	2.38	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10787	1368	4	0	0	0	0	logfile
✘	7oZ1	13118	2024-02-14	2021-06-25	4.0	3.41	—	4.0	0.006	0.92	0.0	0.05	16.76	0.00	2.109	14.20	0.21	7.6	92.4	0.0	-3.23	0.61	0.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8942	1088	4	0	12	0	0	logfile
✘	7R7T	24304	2024-02-22	2021-06-25	4.5	4.85	—	4.6	0.004	1.02	0.0	0.06	15.88	0.01	2.286	6.32	0.00	7.8	92.2	0.0	-3.13	0.81	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35351	4470	13	0	12	0	0	logfile
✘	7F62	31470	2024-02-13	2021-06-24	3.6	4.33	—	4.1	0.003	0.65	0.0	0.04	13.21	0.00	1.925	19.73	1.38	8.1	91.6	0.2	-2.76	0.66	0.62	0.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3321	427	3	0	0	0	0	logfile
✘	7oWG	13097	2024-02-14	2021-06-18	4.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	114114	7078	8	0	110	0	57040	logfile
✘	7oUi	13078	2024-02-20	2021-06-11	2.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	84427	8342	108	0	374	139	0	logfile
✘	7oR0	13036	2024-02-17	2021-06-04	2.64	3.23	2.80	3.0	0.009	0.85	0.0	0.35	16.30	0.01	2.217	2.61	1.15	5.4	94.2	0.3	-1.99	0.72	0.85	3.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19869	2384	16	0	33	52	0	logfile
✘	7N4E	24148	2024-02-21	2021-06-04	3.8	3.85	—	3.8	0.004	0.72	0.0	0.04	17.76	0.01	1.705	13.32	3.45	4.3	95.7	0.0	-0.65	0.78	0.77	1.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29822	3559	10	89	3	0	0	logfile
✘	7EYA	31380	2024-02-13	2021-05-30	3.77	3.98	—	4.0	0.008	1.01	0.0	0.04	16.97	0.01	2.142	8.20	0.00	7.6	92.2	0.2	-2.30	0.60	0.77	2.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4629	576	5	0	3	0	0	logfile
✘	7EWR	31363	2024-02-23	2021-05-26	4.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25779	2516	6	0	0	0	6804	logfile
✘	7EWP	31360	2024-02-19	2021-05-25	4.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20179	1816	4	0	0	0	6804	logfile
✘	7EWK	31350	2024-02-23	2021-05-25	3.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32765	3110	27	0	196	0	0	logfile

• ← previous
• Page 24 of 46
• next →