Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7EWP	31360	2024-02-19	2021-05-25	4.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20179	1816	4	0	0	0	6804	logfile
✘	7EWK	31350	2024-02-23	2021-05-25	3.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32765	3110	27	0	196	0	0	logfile
✘	7EWL	31351	2024-02-15	2021-05-25	3.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13784	994	2	0	0	0	6756	logfile
✘	7EW7	31349	2024-02-15	2021-05-24	3.27	3.91	—	3.9	0.003	0.59	0.0	0.04	13.52	0.00	2.016	6.73	0.71	3.6	96.4	0.0	-2.17	0.56	0.74	2.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9004	1144	6	0	1	0	0	logfile
✘	7EW0	31343	2024-02-15	2021-05-24	3.42	4.10	—	4.1	0.003	0.63	0.0	0.04	14.14	0.00	2.087	6.86	0.71	2.9	97.1	0.0	-1.47	0.59	0.76	1.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8987	1142	6	0	1	0	0	logfile
✘	7EW6	31348	2024-02-24	2021-05-24	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32973	3108	27	0	199	0	0	logfile
✘	7MXL	24073	2024-02-15	2021-05-19	3.2	3.53	—	3.4	0.004	0.61	0.0	0.04	13.08	0.00	2.106	11.34	0.08	5.7	94.3	0.0	-1.92	0.78	0.85	3.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10866	1422	7	0	0	0	0	logfile
✘	7oJL	12955	2024-02-15	2021-05-16	3.3	3.67	3.30	3.4	0.003	0.46	0.0	0.04	13.04	0.00	1.827	7.40	2.98	8.2	91.8	0.1	-2.78	0.86	0.82	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12842	1498	4	33	1	0	0	logfile
✘	7MTR	23995	2024-02-15	2021-05-13	3.3	2.40	—	2.1	0.006	0.93	1.0	0.05	14.01	0.01	2.236	7.85	1.25	4.1	95.9	0.0	-0.18	0.78	0.75	2.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10933	1526	4	0	3	0	0	logfile
✘	7MSX	23971	2024-02-13	2021-05-12	3.15	3.24	3.04	3.2	0.008	0.62	0.0	0.05	10.30	0.00	2.385	0.81	0.00	1.9	98.1	0.0	0.06	0.77	0.85	3.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3706	473	1	0	3	0	0	logfile
✘	7oFQ	12875	2024-02-19	2021-05-05	3.08	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	80691	9493	90	0	849	0	0	logfile
✘	7oE7	12861	2024-02-15	2021-05-01	3.73	3.95	3.97	3.7	0.002	0.53	0.0	0.04	14.33	0.00	2.084	3.86	0.00	6.8	93.2	0.0	-1.48	0.79	0.64	0.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11116	1382	1	0	2	0	0	logfile
✘	7EQD	31258	2024-02-18	2021-05-01	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23122	2302	70	0	92	0	0	logfile
✘	7EQ9	31256	2024-02-14	2021-04-30	3.3	3.70	3.42	3.6	0.002	0.47	0.0	0.04	15.65	0.00	2.267	3.70	0.00	3.3	96.7	0.0	1.85	0.60	0.53	0.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62520	7620	60	0	0	0	0	logfile
✘	7EPX	31249	2024-02-21	2021-04-28	3.0	3.08	—	3.0	0.011	1.03	0.0	0.07	17.35	0.01	1.934	19.43	10.46	10.9	86.7	2.4	-3.96	0.72	0.78	2.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30846	3862	33	0	71	0	0	logfile
✘	7ML4	23908	2024-02-15	2021-04-27	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-2.14	—	—	1.65	2.4	0.003	0.67	0.0	0.04	16.84	0.00	1.985	18.87	3.44	7.7	92.2	0.1	-0.78	—	0.81	0.78	1.47	62733	7907	42	91	138	0	0	logfile
✘	7EPP	31248	2024-02-19	2021-04-27	2.4	2.51	—	2.6	0.004	0.67	0.0	0.04	16.13	0.01	0.073	3.24	3.57	7.3	92.7	0.0	-2.99	0.64	0.81	3.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	80520	10020	60	0	0	1800	0	logfile
✘	7ML7	23909	2024-02-15	2021-04-27	3.17	3.27	—	3.3	0.004	0.75	0.0	0.05	16.19	0.01	2.116	5.73	0.48	7.8	92.1	0.1	-3.39	0.74	0.81	2.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10913	1354	3	0	1	0	0	logfile
✘	7oCA	12802	2024-02-21	2021-04-26	3.4	3.03	—	3.2	0.009	0.96	0.0	0.04	16.90	0.00	2.080	4.67	0.15	3.5	96.5	0.0	0.20	0.72	0.80	3.80	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29294	3802	22	0	72	0	0	logfile
✘	7MKE	23893	2024-02-21	2021-04-23	3.7	4.27	3.78	4.0	0.009	0.86	0.0	0.05	17.41	0.01	2.077	8.96	7.42	8.8	91.1	0.1	-2.11	0.88	0.86	1.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30641	3675	11	81	7	0	0	logfile

• ← previous
• Page 25 of 46
• next →