Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7LY2	23582	2024-02-22	2021-03-05	2.5	2.61	2.57	2.6	0.011	1.24	3.0	0.08	11.26	0.01	2.427	0.64	0.19	1.6	98.4	0.0	0.74	0.72	0.76	4.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	33444	4470	27	0	69	0	0	logfile
✘	7LXT	23574	2024-02-25	2021-03-05	3.4	3.70	3.40	3.7	0.009	0.85	0.0	0.05	14.93	0.00	1.972	18.04	0.79	10.7	89.3	0.0	-2.90	0.75	0.82	2.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	50536	6318	34	0	6	0	0	logfile
✘	7LXZ	23580	2024-02-22	2021-03-05	2.6	2.71	2.68	2.7	0.011	1.22	0.0	0.07	11.32	0.01	2.435	0.76	0.00	2.0	98.0	0.0	0.49	0.74	0.77	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34353	4557	33	0	78	0	0	logfile
✘	7LX2	23564	2024-02-17	2021-03-03	3.12	3.60	—	3.5	0.021	1.72	3.0	0.10	13.14	0.01	2.211	1.58	0.15	1.2	98.8	0.0	0.73	0.79	0.83	3.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20196	2322	54	0	144	0	0	logfile
✘	7NQK	12528	2024-02-13	2021-03-01	3.5	3.75	3.51	3.6	0.005	0.84	0.0	0.05	14.92	0.00	2.035	16.48	0.90	8.6	91.4	0.0	-1.81	0.58	0.82	2.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6139	781	2	0	0	0	0	logfile
✘	7NNL	12478	2024-02-15	2021-02-25	3.1	3.27	3.06	3.2	0.006	0.91	0.0	0.05	16.46	0.01	2.230	6.05	0.00	3.7	96.3	0.0	-1.05	0.70	0.85	2.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11099	1456	6	0	13	0	0	logfile
✘	7LUM	23522	2024-02-15	2021-02-22	4.5	4.68	—	4.6	0.007	0.85	0.0	0.05	14.02	0.00	1.970	26.15	0.00	7.5	92.3	0.2	-0.70	0.79	0.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	63978	8374	16	0	0	0	0	logfile
✘	7LSX	23508	2024-02-24	2021-02-18	3.61	4.24	3.86	4.1	0.003	0.55	0.0	0.04	12.74	0.00	1.942	5.14	0.00	2.2	97.8	0.0	0.77	0.80	0.78	2.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	44393	2838	13	0	0	0	22176	logfile
✘	7NK9	12434	2024-02-17	2021-02-17	2.9	3.29	—	3.2	0.003	0.50	0.0	0.04	13.03	0.00	2.087	6.80	0.00	2.9	97.1	0.0	1.61	0.68	0.86	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18081	1225	14	0	0	0	9158	logfile
✘	7LQZ	23492	2024-02-18	2021-02-15	3.41	3.83	—	3.7	0.013	1.55	0.0	0.06	20.37	0.01	2.211	5.55	0.35	7.3	92.7	0.0	-5.71	0.68	0.79	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22765	2604	8	0	37	0	0	logfile
✘	7E3L	30983	2024-02-22	2021-02-09	3.6	4.10	—	3.6	0.006	0.88	4.0	0.05	13.39	0.01	2.193	9.08	0.32	8.9	91.0	0.1	-2.95	0.68	0.53	2.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32639	4266	12	0	20	0	0	logfile
✘	7NG8	12309	2024-02-17	2021-02-08	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20173	1341	4	0	0	0	9979	logfile
✘	7E32	30974	2024-02-14	2021-02-07	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8797	1117	5	0	2	0	0	logfile
✘	7NFD	12300	2024-02-15	2021-02-06	3.51	3.83	—	3.8	0.009	1.02	1.0	0.05	16.11	0.00	2.071	25.27	0.37	15.9	84.0	0.1	-5.50	0.62	0.81	2.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12394	1582	9	0	5	0	0	logfile
✘	7NF7	12297	2024-02-14	2021-02-05	2.68	2.40	2.58	2.6	0.006	0.71	0.0	0.05	17.23	0.00	2.336	5.26	6.53	4.7	95.1	0.2	-3.11	0.69	0.83	4.47	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9642	1150	8	0	18	0	0	logfile
✘	7E1W	30944	2024-02-24	2021-02-03	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	42695	5132	35	0	59	1	0	logfile
✘	7E1V	30943	2024-02-24	2021-02-03	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	42279	5122	34	0	59	0	0	logfile
✘	7E1X	30945	2024-02-24	2021-02-03	2.93	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	42679	5132	34	0	59	0	0	logfile
✘	7LiA	23365	2024-02-13	2021-01-26	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6279	767	5	0	27	0	0	logfile
✘	7Li9	23364	2024-02-13	2021-01-26	3.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6174	767	5	0	13	0	0	logfile

• ← previous
• Page 27 of 46
• next →