Table showing results for February 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7CZW	30519	2024-02-21	2020-09-09	2.8	2.87	—	2.8	0.011	1.00	0.0	0.07	17.56	0.01	1.981	18.20	11.42	10.0	88.8	1.2	-3.75	0.66	0.74	1.85	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31004	3880	31	0	70	0	0	logfile
✘	7CZY	30521	2024-02-21	2020-09-09	3.3	3.38	—	3.3	0.011	1.02	0.0	0.07	17.63	0.01	1.865	25.79	12.01	10.3	87.0	2.6	-3.80	0.62	0.70	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31186	3880	33	0	76	0	0	logfile
✘	7ABR	11707	2024-02-20	2020-09-08	3.7	3.80	—	3.7	0.011	1.09	0.0	0.05	15.37	0.00	2.066	19.60	0.51	9.6	90.1	0.2	-3.56	0.86	0.83	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27209	3419	13	0	37	0	0	logfile
✘	7K0K	22600	2024-02-13	2020-09-04	2.6	2.96	—	2.9	0.006	0.68	0.0	0.05	12.49	0.00	1.915	7.43	0.00	2.2	97.8	0.0	0.53	0.68	0.85	4.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7615	964	4	0	2	0	0	logfile
✘	7K0P	22606	2024-02-17	2020-09-04	3.1	3.68	—	3.6	0.005	0.71	0.0	0.04	13.77	0.00	2.183	5.21	0.00	2.5	97.5	0.0	0.92	0.69	0.82	3.20	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18572	2342	14	0	15	0	0	logfile
✘	7JVA	22497	2024-02-13	2020-08-20	3.6	3.93	3.68	3.9	0.016	1.51	0.0	0.09	13.10	0.01	2.398	0.80	0.30	1.0	98.8	0.2	0.87	0.84	0.81	3.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3248	420	4	0	3	0	0	logfile
✘	7JRP	22448	2024-02-24	2020-08-12	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	45166	5472	46	0	57	0	0	logfile
✘	7JNA	22403	2024-02-13	2020-08-04	3.6	3.74	—	3.8	0.005	0.72	0.0	0.05	12.95	0.03	2.215	12.10	0.00	4.3	95.7	0.0	-3.83	0.63	0.71	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6432	834	9	0	15	0	0	logfile
✘	7JN4	22401	2024-02-22	2020-08-03	2.68	2.77	—	2.7	0.013	1.22	8.0	0.08	10.93	0.01	2.229	5.48	1.33	2.9	97.1	0.0	-3.84	0.78	0.85	5.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35712	4520	32	0	0	232	0	logfile
✘	7JMJ	22396	2024-02-16	2020-07-31	4.5	5.51	—	4.3	0.007	1.08	0.0	0.05	10.58	0.01	1.373	9.90	0.62	11.3	88.5	0.3	-4.67	0.56	0.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	7JMH	22394	2024-02-16	2020-07-31	4.5	5.68	—	4.4	0.005	1.02	0.0	0.05	10.48	0.01	1.373	9.43	0.46	11.7	88.2	0.1	-4.60	0.56	0.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	7JMF	22392	2024-02-16	2020-07-31	4.5	5.06	—	4.7	0.005	0.98	0.0	0.05	10.23	0.01	1.373	8.08	0.36	11.2	88.6	0.2	-4.91	0.54	0.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	7JMG	22393	2024-02-16	2020-07-31	4.5	7.15	—	4.3	0.005	0.93	0.0	0.05	9.82	0.01	1.373	7.38	0.27	10.3	89.6	0.1	-4.77	0.57	0.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	6ZY9	11555	2024-02-16	2020-07-30	3.3	3.42	—	3.5	0.004	0.81	0.0	0.05	13.73	0.01	2.174	2.45	0.25	4.7	95.3	0.0	-5.76	0.62	0.71	1.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14973	1985	14	0	4	0	0	logfile
✘	6XS6	22301	2024-02-17	2020-07-15	3.7	2.21	—	2.2	0.004	0.83	0.0	0.05	14.26	0.01	2.240	4.49	0.00	6.1	93.9	0.0	-1.99	0.57	0.59	2.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18294	2357	3	0	0	0	0	logfile
✘	6XP5	22284	2024-02-18	2020-07-08	4.2	4.73	—	4.3	0.004	0.90	0.0	0.05	14.32	0.00	2.131	14.90	0.27	15.9	83.2	0.9	-5.23	0.79	0.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21065	2707	15	0	221	0	0	logfile
✘	6Zoo	11326	2024-02-23	2020-07-07	2.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	38497	3341	33	0	243	2	0	logfile
✘	7CG4	30350	2024-02-15	2020-06-30	3.6	4.04	—	3.9	0.003	0.69	0.0	0.04	14.90	0.00	2.192	7.47	0.34	5.1	94.9	0.0	-2.88	0.49	0.77	0.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10943	1419	11	0	0	0	0	logfile
✘	7CG0	30348	2024-02-15	2020-06-30	3.2	3.51	—	3.5	0.003	0.53	0.0	0.04	11.23	0.00	1.992	8.37	2.56	3.0	97.0	0.0	3.52	0.37	0.79	1.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10928	1412	21	0	75	0	0	logfile
✘	6ZJi	11234	2024-02-15	2020-06-29	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile

• ← previous
• Page 30 of 46
• next →