Table showing results for May 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8C8Q	16491	2024-05-10	2023-01-20	3.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14787	1798	17	0	37	0	0	logfile
✘	8BQV	16188	2024-05-07	2023-01-18	2.0	1.96	1.89	1.9	0.008	1.01	0.0	0.07	8.75	0.00	0.000	15.01	0.00	6.8	93.2	0.0	-2.59	0.54	0.77	8.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8595	1155	45	0	105	120	0	logfile
✘	8C80	16467	2024-05-08	2023-01-18	3.4	3.89	3.54	3.8	0.006	0.84	1.0	0.05	15.40	0.01	1.975	6.41	0.75	4.2	95.8	0.0	-1.48	0.65	0.77	1.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10968	1350	7	0	6	0	0	logfile
✘	8BQW	16189	2024-05-11	2023-01-18	2.3	2.12	2.14	2.2	0.008	1.14	0.0	0.07	8.96	0.00	0.052	12.77	0.00	9.6	90.4	0.0	-3.78	0.46	0.75	7.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17385	2310	90	0	270	135	0	logfile
✘	8FU6	29453	2024-05-07	2023-01-16	2.9	3.13	2.94	3.2	0.002	0.60	0.0	0.04	12.46	0.00	2.199	3.83	0.00	2.6	97.4	0.0	0.07	0.58	0.80	3.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8834	1112	6	0	0	0	0	logfile
✘	8C5U	16443	2024-05-08	2023-01-10	3.62	3.71	3.65	3.7	0.005	0.77	0.0	0.05	18.43	0.00	2.189	7.66	0.00	3.0	97.0	0.0	1.11	0.78	0.81	1.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	0.74	—	—	—	1.63	11419	1248	6	71	1	0	0	logfile
✘	8HZN	35089	2024-05-08	2023-01-09	3.25	2.62	3.24	3.1	0.002	0.49	0.0	0.04	8.51	0.00	2.182	6.40	3.12	5.2	94.7	0.1	-3.99	0.78	0.77	2.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10200	1330	4	0	2	0	0	logfile
✘	8HZC	35088	2024-05-06	2023-01-08	3.2	3.16	2.79	3.3	0.002	0.51	0.0	0.05	13.53	0.00	2.497	11.14	0.00	11.3	88.7	0.0	-5.03	0.39	0.85	4.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3108	450	6	0	0	0	0	logfile
✘	8FQG	29387	2024-05-07	2023-01-06	3.01	2.41	2.83	3.0	0.015	0.73	0.0	0.06	17.67	0.00	2.233	8.45	0.22	2.3	97.7	0.0	-0.50	0.62	0.85	2.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8392	1064	16	0	4	10	0	logfile
✘	8FQD	29384	2024-05-07	2023-01-06	3.01	2.62	3.02	3.0	0.015	0.73	0.0	0.06	17.60	0.00	2.264	6.54	0.11	3.3	96.7	0.0	-0.68	0.64	0.83	1.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8384	1064	14	0	4	2	0	logfile
✘	8FQ2	29375	2024-05-07	2023-01-05	3.14	2.91	2.99	3.1	0.015	0.76	0.0	0.06	15.95	0.00	2.235	9.44	0.67	4.7	95.3	0.0	-0.58	0.56	0.71	1.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8390	1064	12	0	4	0	0	logfile
✘	8C4T	16428	2024-05-08	2023-01-04	3.23	3.32	3.18	3.3	0.003	0.58	2.0	0.05	16.97	0.00	2.148	8.51	0.36	2.9	97.1	0.0	0.76	0.79	0.84	2.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10459	1268	3	12	1	0	0	logfile
✘	8Foi	29350	2024-05-17	2022-12-30	2.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35120	2120	21	0	81	0	16834	logfile
✘	8FoA	29343	2024-05-12	2022-12-30	2.66	2.96	2.81	2.9	0.023	1.52	0.0	0.53	22.53	0.01	2.298	7.30	0.42	5.2	94.7	0.0	-5.28	0.66	0.84	4.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21287	2448	8	0	53	0	0	logfile
✘	8FoB	29344	2024-05-12	2022-12-30	2.71	2.96	2.77	3.0	0.024	1.57	0.0	0.54	21.84	0.01	2.073	8.34	0.39	8.3	91.7	0.0	-5.44	0.60	0.72	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20390	2376	12	0	46	52	0	logfile
✘	8HWG	35057	2024-05-11	2022-12-29	3.0	3.09	2.85	3.0	0.004	0.66	0.0	0.04	18.54	0.00	1.832	7.63	4.33	6.0	93.9	0.0	-1.90	0.76	0.87	3.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18110	2209	13	6	12	0	0	logfile
✘	8HWB	35052	2024-05-13	2022-12-29	3.9	4.06	3.80	3.9	0.003	0.63	0.0	0.04	16.50	0.00	1.900	9.80	0.59	3.7	96.2	0.0	-1.13	0.80	0.84	1.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25740	3147	13	6	10	0	0	logfile
✘	8HWE	35055	2024-05-11	2022-12-29	3.3	3.47	3.28	3.5	0.003	0.61	0.0	0.04	17.84	0.00	1.956	10.09	0.62	8.5	91.5	0.0	-1.52	0.72	0.80	1.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17247	2112	12	0	11	0	0	logfile
✘	8Fo1	29338	2024-05-13	2022-12-29	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24481	1596	4	0	0	0	12140	logfile
✘	8HW4	35050	2024-05-08	2022-12-28	3.52	3.89	3.62	3.8	0.033	1.39	0.0	0.17	15.27	0.01	2.142	14.67	0.09	8.2	91.8	0.0	-2.38	0.67	0.80	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10746	1364	1	0	2	0	0	logfile

• ← previous
• Page 10 of 54
• next →