Table showing results for June 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7WST	32766	2024-06-26	2022-02-01	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9438	1202	4	0	8	0	0	logfile
✘	7WSU	32767	2024-06-26	2022-02-01	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9440	1202	4	0	8	0	0	logfile
✘	7WSF	32756	2024-06-27	2022-01-29	2.87	3.08	—	3.1	0.003	0.44	0.0	0.04	11.23	0.00	2.016	6.14	3.87	2.7	97.3	0.0	-0.12	0.72	0.81	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7170	879	3	0	1	0	0	logfile
✘	7WSi	32759	2024-06-24	2022-01-29	3.32	3.90	—	3.8	0.003	0.67	0.0	0.04	12.25	0.00	2.122	8.82	0.00	7.9	92.1	0.0	-0.23	0.66	0.77	1.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5701	743	3	0	0	0	0	logfile
✘	7WRL	32732	2024-06-24	2022-01-27	3.51	3.69	—	3.6	0.006	1.03	0.0	0.06	14.71	0.01	2.289	5.84	0.00	13.4	86.6	0.0	-4.19	0.64	0.78	2.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3251	419	3	0	0	0	0	logfile
✘	7TQV	26073	2024-06-29	2022-01-27	3.43	3.72	—	3.7	0.002	0.38	0.0	0.04	10.87	0.00	2.162	5.00	0.82	3.8	96.2	0.0	-0.34	0.68	0.69	2.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17792	2083	8	66	0	0	0	logfile
✘	7WLM	32588	2024-06-25	2022-01-13	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7308	603	9	0	51	54	0	logfile
✘	7WLD	32582	2024-06-30	2022-01-13	2.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19732	2393	11	0	29	0	0	logfile
✘	7QPD	14119	2024-06-27	2022-01-03	3.73	3.98	—	3.9	0.005	0.81	0.0	0.05	12.54	0.00	2.225	9.51	0.09	4.9	95.0	0.1	-1.20	0.80	0.76	2.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11521	1544	7	0	10	0	0	logfile
✘	7WDB	32436	2024-06-30	2021-12-21	2.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22400	2660	8	0	28	0	0	logfile
✘	7WCU	32429	2024-06-24	2021-12-20	3.09	3.27	—	3.2	0.009	1.15	0.0	0.06	13.76	0.01	2.289	6.61	0.29	7.8	92.2	0.0	-2.63	0.61	0.82	3.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3248	416	3	0	0	0	0	logfile
✘	7T9M	25762	2024-06-28	2021-12-19	3.1	4.03	3.21	3.4	0.005	0.88	2.0	0.06	12.80	0.01	2.079	5.13	0.91	4.0	96.0	0.0	0.15	0.70	0.76	3.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15546	995	5	0	5	0	7719	logfile
✘	7T92	25750	2024-06-30	2021-12-17	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18777	1159	8	0	25	0	9156	logfile
✘	7T6L	25718	2024-06-29	2021-12-14	3.7	4.01	—	3.9	0.007	1.18	0.0	0.07	15.11	0.01	2.245	5.37	0.00	4.8	95.2	0.0	-4.03	0.68	0.82	1.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19412	2424	4	0	0	0	0	logfile
✘	7T6M	25719	2024-06-29	2021-12-14	2.8	3.05	—	3.1	0.006	1.07	0.0	0.07	15.21	0.01	2.300	3.31	0.00	1.7	98.3	0.0	-2.68	0.71	0.84	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19600	2424	8	0	4	0	0	logfile
✘	7T6X	25730	2024-06-26	2021-12-14	3.83	4.14	3.83	4.0	0.022	1.97	0.0	0.13	15.96	0.02	1.505	3.89	0.00	3.8	96.1	0.1	-0.16	0.77	0.82	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9217	1140	19	0	37	0	0	logfile
✘	7W9P	32371	2024-06-28	2021-12-10	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14817	1705	8	0	40	0	0	logfile
✘	7W9L	32369	2024-06-28	2021-12-10	3.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14915	1712	8	0	40	0	0	logfile
✘	7W9M	32370	2024-06-28	2021-12-10	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14219	1710	7	0	18	0	0	logfile
✘	7W9T	32372	2024-06-28	2021-12-10	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14841	1709	8	0	39	0	0	logfile

• ← previous
• Page 19 of 36
• next →