Table showing results for August 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	8G1U	29677	2024-08-10	2023-02-03	2.83	3.09	2.91	3.1	0.009	0.93	5.0	0.06	14.70	0.01	2.214	6.28	0.59	2.8	97.0	0.1	-1.25	0.68	0.87	4.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29048	3651	20	0	4	0	0	logfile
✘	8G15	29662	2024-08-04	2023-02-01	2.07	2.66	1.97	2.4	0.005	0.96	0.0	0.05	16.07	0.01	2.243	5.30	1.59	5.0	95.0	0.0	-1.62	0.88	0.90	5.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10056	1336	4	0	0	0	0	logfile
✘	8CE7	16600	2024-08-04	2023-02-01	2.7	2.34	2.46	2.7	0.010	1.47	12.0	0.09	13.19	0.01	0.000	16.57	3.33	9.0	91.0	0.0	-3.63	0.44	0.73	6.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10512	1512	24	0	0	0	0	logfile
✘	8FXH	29533	2024-08-10	2023-01-24	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	-1.03	—	—	0.18	2.9	0.003	0.70	0.0	0.05	18.01	0.01	2.519	4.94	1.43	6.8	92.9	0.4	-1.01	—	0.76	0.83	1.86	30228	3786	6	0	0	0	0	logfile
✘	8FXi	29534	2024-08-10	2023-01-24	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29641	3684	10	0	6	0	0	logfile
✘	8i51	35190	2024-08-09	2023-01-21	2.76	2.98	2.80	3.0	0.012	1.10	18.0	0.10	16.68	0.01	2.130	10.05	0.69	8.5	91.3	0.2	-1.86	0.71	0.73	3.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25416	3168	12	0	18	0	0	logfile
✘	8FVW	29494	2024-08-09	2023-01-19	2.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26108	3165	18	52	5	225	0	logfile
✘	8i4A	35167	2024-08-04	2023-01-19	3.4	3.59	3.42	3.6	0.012	0.94	0.0	0.05	15.10	0.01	2.115	13.72	0.00	5.1	94.9	0.0	-1.46	0.61	0.79	2.13	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9763	1218	2	0	1	0	0	logfile
✘	8BQV	16188	2024-08-03	2023-01-18	2.0	1.96	1.89	1.9	0.008	1.01	0.0	0.07	8.75	0.00	0.000	15.13	0.00	6.8	93.2	0.0	-2.59	0.54	0.77	8.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8595	1155	45	0	105	120	0	logfile
✘	8BQW	16189	2024-08-06	2023-01-18	2.3	2.12	2.14	2.2	0.008	1.14	0.0	0.07	8.96	0.00	0.052	12.77	0.00	9.6	90.4	0.0	-3.78	0.46	0.75	7.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17385	2310	90	0	270	135	0	logfile
✘	8FUK	29459	2024-08-08	2023-01-17	3.36	3.71	3.47	3.7	0.003	0.56	0.0	0.04	17.11	0.01	2.068	8.01	0.24	4.4	95.6	0.0	0.29	0.78	0.85	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23608	2784	11	60	0	0	0	logfile
✘	8FU8	29455	2024-08-09	2023-01-16	3.08	2.74	3.01	3.0	0.013	1.29	0.0	0.11	10.27	0.00	2.336	1.90	0.14	5.4	93.6	1.1	-0.39	0.75	0.85	3.36	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25469	3165	6	0	48	0	0	logfile
✘	8HZX	35091	2024-08-09	2023-01-09	2.68	2.91	2.72	2.8	0.006	0.77	0.0	0.06	15.72	0.00	2.107	8.72	0.00	6.4	93.4	0.2	-1.13	0.80	0.86	3.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25320	3180	6	0	0	0	0	logfile
✘	8FoZ	29357	2024-08-08	2023-01-03	2.0	2.03	2.09	2.0	0.009	0.92	0.0	0.06	15.79	0.01	2.238	2.94	1.31	0.5	99.5	0.0	0.22	0.80	0.91	7.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23648	3072	16	0	16	0	0	logfile
✘	8Fo1	29338	2024-08-08	2022-12-29	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24481	1596	4	0	0	0	12140	logfile
✘	8HUD	35035	2024-08-04	2022-12-23	3.43	3.64	3.43	3.6	0.005	0.84	0.0	0.06	20.89	0.00	2.284	10.27	0.56	9.8	90.2	0.0	-1.38	0.71	0.70	1.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8670	767	4	108	0	0	0	logfile
✘	8C1V	16383	2024-08-09	2022-12-21	2.9	3.34	3.04	3.2	0.004	0.60	1.0	0.05	13.68	0.00	1.819	8.18	0.40	4.4	95.6	0.0	-0.12	0.75	0.64	1.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25590	3198	15	0	51	0	0	logfile
✘	8C21	16387	2024-08-05	2022-12-21	3.6	4.19	3.27	3.8	0.003	0.58	0.0	0.04	14.61	0.00	2.223	10.61	0.07	5.2	94.4	0.4	0.00	0.65	0.67	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11954	1441	6	0	2	0	0	logfile
✘	8HTT	35017	2024-08-02	2022-12-21	3.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3292	389	5	0	8	0	0	logfile
✘	8HSY	35008	2024-08-09	2022-12-20	2.53	2.70	2.54	2.6	0.004	0.71	0.0	0.05	15.46	0.00	2.153	7.52	0.80	6.2	93.6	0.2	-0.75	0.83	0.86	3.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25320	3180	6	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 10 of 39
• next →