Table showing results for August 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7EWL	31351	2024-08-05	2021-05-25	3.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13784	994	2	0	0	0	6756	logfile
✘	7N0L	24108	2024-08-02	2021-05-25	2.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5270	626	4	0	2	0	0	logfile
✘	7EWP	31360	2024-08-09	2021-05-25	4.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20179	1816	4	0	0	0	6804	logfile
✘	7MXD	24071	2024-08-10	2021-05-19	3.4	3.54	3.38	3.5	0.005	0.72	1.0	0.06	16.46	0.00	2.107	7.65	0.00	5.9	94.1	0.0	-1.62	0.80	0.80	2.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	29496	3519	58	0	146	0	0	logfile
✘	7EUo	31323	2024-08-03	2021-05-18	2.9	3.61	2.97	3.5	0.004	0.65	0.0	0.05	13.72	0.00	2.198	6.82	0.00	4.3	95.7	0.0	-0.21	0.63	0.82	3.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8950	1138	7	0	2	0	0	logfile
✘	7oK0	12960	2024-08-09	2021-05-17	2.9	3.35	2.78	3.2	0.021	0.93	0.0	0.22	12.91	0.00	2.038	5.46	0.00	3.7	96.3	0.0	0.12	0.78	0.85	3.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25636	3234	18	0	8	0	0	logfile
✘	7MTS	23996	2024-08-06	2021-05-13	3.2	3.09	—	3.0	0.007	0.77	0.0	0.05	13.16	0.01	2.213	4.48	0.13	3.1	96.9	0.0	0.41	0.83	0.84	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16068	2150	8	0	3	0	0	logfile
✘	7MR3	23955	2024-08-08	2021-05-07	3.6	4.01	—	3.9	0.005	0.83	0.0	0.05	16.47	0.01	2.250	5.33	0.00	6.5	93.5	0.0	-1.62	0.83	0.82	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23615	2854	5	40	0	0	0	logfile
✘	7MQB	23941	2024-08-08	2021-05-05	3.25	3.29	3.22	3.3	0.007	0.72	0.0	0.05	14.34	0.00	2.302	2.48	0.66	0.5	99.5	0.0	1.28	0.81	0.86	4.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12760	1640	16	16	0	0	0	logfile
✘	7Mo8	23920	2024-08-04	2021-05-01	4.5	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9877	1250	3	0	6	0	0	logfile
✘	7Mo9	23921	2024-08-04	2021-05-01	4.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9755	1247	4	0	6	0	0	logfile
✘	7Mo7	23919	2024-08-07	2021-05-01	4.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18135	2329	5	0	6	0	0	logfile
✘	7MoA	23922	2024-08-05	2021-05-01	4.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12511	1580	5	0	12	0	0	logfile
✘	7MM0	23915	2024-08-10	2021-04-29	3.15	3.84	3.25	3.4	0.004	0.60	0.0	0.05	16.16	0.00	2.191	7.00	0.00	5.5	94.4	0.1	-0.97	0.84	0.83	2.12	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	28057	3490	22	0	56	0	0	logfile
✘	7MLU	23910	2024-08-08	2021-04-29	4.1	5.27	—	4.2	0.004	0.88	0.0	0.05	9.81	0.01	2.271	7.00	0.21	6.4	93.6	0.0	-4.41	0.72	0.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21886	2746	20	0	5	0	0	logfile
✘	7MLZ	23914	2024-08-02	2021-04-29	3.71	4.27	3.83	3.9	0.004	0.82	0.0	0.05	14.73	0.01	2.150	18.13	0.00	17.4	82.5	0.2	-4.08	0.80	0.62	1.39	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4864	624	4	0	5	0	0	logfile
✘	7MKP	23902	2024-08-09	2021-04-26	3.41	4.33	—	3.7	0.005	1.09	4.0	0.06	14.85	0.01	1.831	22.24	0.81	8.2	91.4	0.4	-2.49	0.90	0.81	1.25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24943	3193	6	0	3	0	0	logfile
✘	7MKM	23899	2024-08-02	2021-04-24	3.16	2.47	—	2.2	0.003	0.79	0.0	0.05	13.04	0.01	2.177	7.69	0.00	2.8	97.2	0.0	-1.30	0.52	0.58	1.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3192	406	4	0	1	0	0	logfile
✘	7MJo	23880	2024-08-07	2021-04-20	4.0	4.18	—	4.1	0.008	1.06	0.0	0.05	16.27	0.01	1.857	8.45	0.00	9.0	91.0	0.0	-1.30	0.57	0.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19977	2981	13	0	25	0	0	logfile
✘	7Mi3	23838	2024-08-04	2021-04-16	3.5	3.72	3.45	3.6	0.012	1.47	0.0	0.08	13.20	0.01	1.978	5.17	1.94	6.8	92.8	0.3	-1.80	0.85	0.86	3.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9682	1192	2	0	4	0	0	logfile

• ← previous
• Page 27 of 39
• next →