Table showing results for August 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7MHS	23835	2024-08-07	2021-04-15	3.6	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21148	2652	11	0	48	0	0	logfile
✘	7MDo	23776	2024-08-09	2021-04-05	4.12	4.28	—	4.2	0.005	1.06	0.0	0.06	15.75	0.01	2.283	6.87	0.00	6.7	93.3	0.0	-3.01	0.75	0.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25098	3186	12	0	6	0	0	logfile
✘	7o1Q	12696	2024-08-11	2021-03-30	3.4	3.81	—	3.4	0.007	0.55	0.0	0.05	9.97	0.00	2.129	4.28	0.39	2.7	97.3	0.0	-0.21	0.85	0.81	4.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32434	2051	7	0	0	0	15921	logfile
✘	7M6H	23696	2024-08-09	2021-03-25	4.0	4.24	—	3.9	0.006	1.13	7.0	0.07	13.70	0.01	2.170	14.11	0.27	7.0	92.9	0.1	-2.57	0.76	0.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27379	3476	10	0	28	0	0	logfile
✘	7M3N	23658	2024-08-02	2021-03-18	2.4	2.15	2.40	1.9	0.005	0.63	0.0	0.04	15.95	0.00	2.168	5.79	4.28	4.3	95.6	0.1	-2.53	0.43	0.82	4.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6004	759	3	0	0	0	0	logfile
✘	7NV0	12601	2024-08-04	2021-03-15	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9928	1180	7	53	1	0	0	logfile
✘	7NT6	12584	2024-08-08	2021-03-09	4.3	4.34	3.99	3.3	0.012	2.07	0.0	0.15	12.20	0.01	2.119	1.13	0.00	4.0	95.6	0.3	-2.44	0.72	0.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24128	5582	17	90	0	0	0	logfile
✘	7EB0	31048	2024-08-09	2021-03-08	3.6	4.22	—	4.0	0.004	0.66	0.0	0.05	15.82	0.00	2.188	7.18	0.00	5.9	94.1	0.0	-1.14	0.81	0.79	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24946	3055	35	0	80	0	0	logfile
✘	7LYT	23601	2024-08-06	2021-03-08	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14354	712	6	92	6	0	6722	logfile
✘	7EAZ	31047	2024-08-09	2021-03-08	3.5	4.16	—	4.0	0.004	0.67	0.0	0.05	15.47	0.00	2.146	8.23	0.00	5.3	94.7	0.0	-1.15	0.79	0.77	2.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24956	3051	38	0	82	0	0	logfile
✘	7LYL	23594	2024-08-08	2021-03-07	3.72	4.02	—	3.8	0.013	1.70	2.0	0.09	13.01	0.01	2.538	0.17	0.69	5.7	94.2	0.1	-1.00	0.81	0.83	2.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23826	3003	6	0	28	0	0	logfile
✘	7LX2	23564	2024-08-07	2021-03-03	3.12	3.60	—	3.5	0.021	1.72	3.0	0.10	13.14	0.01	2.211	1.58	0.15	1.2	98.8	0.0	0.73	0.79	0.83	3.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20196	2322	54	0	144	0	0	logfile
✘	7LWL	23549	2024-08-08	2021-03-01	2.84	3.04	—	3.0	0.013	1.79	2.0	0.10	12.81	0.01	2.505	0.04	0.53	4.2	95.6	0.2	-0.78	0.72	0.83	4.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23847	3003	6	0	30	0	0	logfile
✘	7NNU	12484	2024-08-03	2021-02-25	2.7	2.67	2.73	2.8	0.007	0.79	0.0	0.05	14.02	0.01	2.251	4.56	0.00	2.1	97.9	0.0	-0.65	0.68	0.87	3.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7724	982	8	0	0	35	0	logfile
✘	7NKU	12448	2024-08-09	2021-02-19	3.4	3.03	—	3.1	0.008	0.94	0.0	0.05	15.33	0.01	1.986	17.36	0.00	9.2	90.8	0.0	-0.63	0.74	0.77	1.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25332	3252	12	0	18	0	0	logfile
✘	7NKQ	12446	2024-08-04	2021-02-18	2.98	3.25	—	3.1	0.004	0.49	0.0	0.04	13.52	0.00	2.018	7.16	0.00	2.7	97.3	0.0	1.39	0.81	0.81	2.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10621	714	8	0	0	0	5312	logfile
✘	7E4i	30986	2024-08-04	2021-02-13	3.05	3.25	—	3.2	0.002	0.48	0.0	0.04	9.90	0.00	2.212	4.54	1.42	3.5	96.5	0.0	0.19	0.70	0.83	2.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11336	1426	6	0	0	0	0	logfile
✘	7NG8	12309	2024-08-07	2021-02-08	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20173	1341	4	0	0	0	9979	logfile
✘	7ND9	12280	2024-08-09	2021-01-30	2.8	3.07	—	3.0	0.003	0.57	0.0	0.05	11.72	0.00	2.198	4.33	0.62	4.9	94.9	0.2	-0.76	0.75	0.83	2.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	27336	3482	19	0	50	0	0	logfile
✘	7LJ3	23388	2024-08-09	2021-01-28	2.9	2.92	—	3.4	0.005	0.72	0.0	0.04	20.50	0.00	1.041	27.61	3.30	3.6	96.0	0.4	0.29	0.10	0.23	-0.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25714	2564	12	225	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 28 of 39
• next →