Table showing results for August 2025

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6LHS	0896	2025-08-24	2019-12-10	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22737	1456	2	0	0	0	11313	logfile
✘	6V4N	21042	2025-08-25	2019-11-28	2.5	2.75	—	2.7	0.010	1.05	0.0	0.07	16.02	0.01	1.991	4.86	1.03	6.4	93.5	0.0	-3.16	0.76	0.85	3.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25866	3286	40	0	36	182	0	logfile
✘	6UZ8	20953	2025-08-24	2019-11-14	2.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23320	2936	8	0	16	0	0	logfile
✘	6UXA	20931	2025-08-23	2019-11-07	4.5	5.05	—	6.0	0.005	0.77	0.0	0.06	4.56	0.00	2.628	0.00	0.00	3.8	96.2	0.0	-2.56	0.71	0.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10344	2104	8	0	0	0	0	logfile
✘	6UWZ	20928	2025-08-24	2019-11-06	2.69	2.88	2.76	2.8	0.011	0.92	0.0	0.05	15.21	0.01	1.501	8.35	0.00	5.6	94.4	0.0	-2.64	0.74	0.87	4.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18330	2178	23	0	40	138	0	logfile
✘	6UW9	20920	2025-08-24	2019-11-04	4.33	4.42	—	4.3	0.005	1.14	0.0	0.06	15.43	0.01	1.932	8.33	0.20	7.3	92.7	0.0	-4.94	0.67	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18924	2328	4	0	0	0	0	logfile
✘	6T93	10408	2025-08-23	2019-10-25	3.49	4.10	—	3.7	0.014	1.15	0.0	0.06	27.10	0.01	2.435	0.74	0.00	0.3	99.7	0.0	0.78	0.87	0.85	2.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12199	758	10	302	0	0	0	logfile
✘	6L35	0821	2025-08-26	2019-10-09	3.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34822	3260	30	0	205	0	0	logfile
✘	6UHC	20770	2025-08-23	2019-09-27	3.9	4.44	—	4.3	0.009	1.46	6.0	0.08	14.09	0.01	1.961	12.25	0.21	7.8	91.6	0.6	-3.16	0.76	0.72	1.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14680	1940	11	0	4	0	0	logfile
✘	6UFR	20759	2025-08-22	2019-09-24	2.5	2.80	—	2.8	0.012	0.96	0.0	0.07	13.71	0.01	2.209	5.48	0.00	6.6	93.4	0.0	-1.99	0.50	0.87	5.55	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4420	630	20	0	0	90	0	logfile
✘	6KZ4	0785	2025-08-24	2019-09-23	3.0	3.18	—	3.1	0.005	0.64	0.0	0.05	13.57	0.00	2.170	10.13	0.00	9.5	90.5	0.0	-4.51	0.80	0.86	2.99	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16698	2196	6	0	0	0	0	logfile
✘	6UEN	20754	2025-08-23	2019-09-22	3.67	3.75	—	3.7	0.006	0.65	0.0	0.04	14.23	0.00	2.112	9.01	0.13	4.6	95.4	0.0	-2.28	0.73	0.83	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13705	1696	5	0	0	0	0	logfile
✘	6UE9	20751	2025-08-24	2019-09-20	2.9	3.89	—	4.2	0.007	1.07	0.0	0.06	14.61	0.01	2.241	3.07	0.32	11.2	88.8	0.0	-3.87	0.59	0.37	0.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18227	2475	17	0	12	0	0	logfile
✘	6SWD	10323	2025-08-26	2019-09-20	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	41548	2293	28	1064	30	26	0	logfile
✘	6SWE	10324	2025-08-24	2019-09-20	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22737	1523	21	486	9	18	0	logfile
✘	6UAN	20708	2025-08-22	2019-09-11	3.9	4.03	—	3.9	0.007	0.95	0.0	0.06	16.09	0.01	2.256	7.56	1.03	8.1	91.9	0.0	-5.36	0.76	0.80	1.99	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7685	1007	4	0	0	0	0	logfile
✘	6U9V	20702	2025-08-25	2019-09-09	2.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26737	1680	18	3	54	0	12670	logfile
✘	6U9W	20703	2025-08-25	2019-09-09	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26952	1686	12	3	42	0	12918	logfile
✘	6U8R	20690	2025-08-26	2019-09-05	3.91	3.97	3.82	3.9	0.019	1.84	0.0	0.08	17.00	0.01	2.188	10.06	3.21	8.7	91.0	0.3	-4.40	0.61	0.81	2.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31528	4016	24	0	32	0	0	logfile
✘	6SMQ	10245	2025-08-26	2019-08-22	3.3	3.30	—	3.3	0.011	1.04	0.0	0.06	14.92	0.01	2.261	3.37	0.43	7.4	92.4	0.2	-3.34	0.78	0.88	4.04	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22136	2791	9	0	9	0	0	logfile

• ← previous
• Page 50 of 57
• next →