Table showing results for November 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7TGE	25880	2024-11-20	2022-01-07	3.68	4.05	3.74	3.7	0.004	0.76	0.0	0.06	13.34	0.01	2.270	3.50	0.09	3.8	96.2	0.0	-1.30	0.80	0.72	0.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21461	2677	15	0	40	0	0	logfile
✘	7TF5	25862	2024-11-19	2022-01-06	3.16	3.97	—	3.4	0.004	0.75	0.0	0.05	13.18	0.01	2.262	3.03	0.37	2.1	97.9	0.0	-0.17	0.86	0.83	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	50298	6228	48	0	120	0	0	logfile
✘	7TFJ	25874	2024-11-20	2022-01-06	3.3	3.54	—	3.5	0.003	0.63	0.0	0.04	15.19	0.00	2.088	7.61	0.09	2.8	97.2	0.0	0.19	0.76	0.81	2.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20607	2486	15	42	9	0	0	logfile
✘	7TF2	25859	2024-11-19	2022-01-06	3.62	4.27	—	3.8	0.004	0.74	0.0	0.05	13.05	0.01	2.277	3.32	0.35	2.1	97.9	0.0	-0.12	0.86	0.82	1.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	50292	6228	48	0	120	0	0	logfile
✘	7WiW	32538	2024-11-15	2022-01-05	3.12	3.47	—	3.4	0.006	0.99	1.0	0.05	14.75	0.01	1.891	8.72	1.03	7.1	92.3	0.6	-4.54	0.72	0.89	3.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8603	1137	4	0	5	0	0	logfile
✘	7TCP	25816	2024-11-17	2021-12-27	3.84	3.97	—	3.9	0.002	0.37	0.0	0.03	9.57	0.00	2.327	4.21	1.26	2.8	97.2	0.0	2.66	0.70	0.81	2.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14992	1912	12	0	12	0	0	logfile
✘	7Qo1	14080	2024-11-17	2021-12-23	4.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14179	1694	9	62	1	0	0	logfile
✘	7TC0	25803	2024-11-17	2021-12-22	3.1	3.02	2.78	3.2	0.003	0.59	3.0	0.04	15.73	0.01	1.817	8.24	2.49	4.1	95.9	0.0	-1.78	0.74	0.81	1.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13809	1781	4	0	11	0	0	logfile
✘	7QL3	14062	2024-11-14	2021-12-19	3.32	3.47	3.01	3.5	0.011	2.01	8.0	0.11	12.27	0.01	2.489	0.00	0.00	7.7	92.3	0.0	-3.47	0.46	0.82	4.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3246	426	6	0	0	0	0	logfile
✘	7QKS	14050	2024-11-15	2021-12-18	3.1	3.39	3.08	3.3	0.005	0.74	0.0	0.05	14.59	0.01	2.210	4.65	0.10	1.8	98.2	0.0	0.65	0.75	0.87	2.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9339	1199	2	0	1	0	0	logfile
✘	7T9B	25755	2024-11-20	2021-12-18	3.72	4.06	3.76	3.9	0.021	1.77	0.0	0.13	12.57	0.01	2.289	1.04	0.98	3.7	95.6	0.7	0.40	0.81	0.86	2.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21592	2595	42	0	101	0	0	logfile
✘	7T92	25750	2024-11-20	2021-12-17	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18777	1159	8	0	25	0	9156	logfile
✘	7T6K	25717	2024-11-19	2021-12-14	3.0	3.29	—	3.3	0.005	1.05	1.0	0.06	14.25	0.01	2.313	3.34	0.05	3.3	96.7	0.0	-3.51	0.68	0.82	3.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19412	2424	4	0	0	0	0	logfile
✘	7T6X	25730	2024-11-15	2021-12-14	3.83	4.14	3.83	4.0	0.022	1.97	0.0	0.13	15.96	0.02	1.505	3.89	0.00	3.8	96.1	0.1	-0.16	0.77	0.82	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9217	1140	19	0	37	0	0	logfile
✘	7QET	13940	2024-11-19	2021-12-03	2.1	2.53	2.11	2.3	0.006	0.88	0.0	0.04	13.42	0.00	2.140	1.99	2.38	2.2	97.8	0.0	1.49	0.82	0.90	3.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19205	2256	36	0	60	305	0	logfile
✘	7QER	13938	2024-11-19	2021-12-03	2.2	2.66	2.18	2.3	0.009	0.94	0.0	0.05	14.11	0.00	2.117	3.04	2.94	1.6	98.4	0.0	-0.05	0.84	0.88	3.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19097	2244	36	0	60	305	0	logfile
✘	7QDS	13925	2024-11-17	2021-11-30	3.8	3.53	3.57	3.7	0.005	0.86	1.0	0.05	14.59	0.01	2.067	14.28	0.00	5.7	94.3	0.0	-0.33	0.80	0.82	1.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13798	1771	4	0	0	0	0	logfile
✘	7T02	25577	2024-11-17	2021-11-29	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14359	1752	4	25	5	0	0	logfile
✘	7QD8	13910	2024-11-17	2021-11-26	3.6	3.90	3.66	3.8	0.004	0.74	0.0	0.05	14.49	0.00	2.273	5.28	0.00	2.3	97.7	0.0	-1.83	0.74	0.69	1.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14086	1730	2	0	0	0	0	logfile
✘	7W2J	32262	2024-11-18	2021-11-24	3.6	2.90	—	3.6	0.030	1.49	0.0	0.56	15.66	0.01	2.011	18.00	0.00	11.0	88.7	0.4	-2.64	0.65	0.79	1.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16522	2104	10	0	10	0	0	logfile

• ← previous
• Page 22 of 38
• next →