Table showing results for November 2024

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7WVF	32852	2024-11-17	2022-02-10	3.91	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14249	1546	5	46	46	0	0	logfile
✘	7WVJ	32853	2024-11-17	2022-02-10	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12488	1318	4	46	46	0	0	logfile
✘	7WV5	32846	2024-11-17	2022-02-09	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12958	1318	16	46	80	0	0	logfile
✘	7WTQ	32795	2024-11-19	2022-02-05	3.7	3.57	—	3.4	0.005	0.90	0.0	0.05	22.13	0.01	2.146	6.91	0.04	8.0	91.8	0.1	-1.90	0.82	0.79	1.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	51309	3079	19	1255	1	0	0	logfile
✘	7TTS	26122	2024-11-19	2022-02-01	2.9	12.34	—	—	0.008	0.99	1.0	0.08	12.97	0.01	1.788	5.64	0.30	3.2	96.6	0.1	1.89	0.77	0.55	-0.20	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18793	2686	12	0	23	0	0	logfile
✘	7WSQ	32764	2024-11-18	2022-02-01	3.8	3.52	—	3.9	0.038	1.52	0.0	0.45	14.72	0.01	1.827	11.77	0.00	4.9	95.1	0.0	-0.66	0.68	0.75	1.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16522	2104	10	0	10	0	0	logfile
✘	7TPT	26063	2024-11-19	2022-01-26	3.9	2.60	3.92	3.8	0.009	0.89	5.0	0.05	14.37	0.00	1.752	10.02	0.45	4.0	96.0	0.0	1.17	0.68	0.61	1.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	50755	7217	67	0	47	0	0	logfile
✘	7TKT	25981	2024-11-17	2022-01-17	3.6	3.75	3.75	3.7	0.007	1.26	0.0	0.04	21.05	0.01	2.224	6.30	0.00	4.7	95.3	0.0	0.63	0.72	0.81	2.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13252	1560	8	0	56	0	0	logfile
✘	7TGE	25880	2024-11-20	2022-01-07	3.68	4.05	3.74	3.7	0.004	0.76	0.0	0.06	13.34	0.01	2.270	3.50	0.09	3.8	96.2	0.0	-1.30	0.80	0.72	0.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21461	2677	15	0	40	0	0	logfile
✘	7TGG	25881	2024-11-18	2022-01-07	4.1	4.67	—	4.4	0.004	0.71	0.0	0.05	11.74	0.01	2.070	15.91	0.00	7.4	92.6	0.0	-2.21	0.66	0.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18255	2445	30	0	0	0	0	logfile
✘	7TFJ	25874	2024-11-20	2022-01-06	3.3	3.54	—	3.5	0.003	0.63	0.0	0.04	15.19	0.00	2.088	7.61	0.09	2.8	97.2	0.0	0.19	0.76	0.81	2.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20607	2486	15	42	9	0	0	logfile
✘	7TF2	25859	2024-11-19	2022-01-06	3.62	4.27	—	3.8	0.004	0.74	0.0	0.05	13.05	0.01	2.277	3.32	0.35	2.1	97.9	0.0	-0.12	0.86	0.82	1.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	50292	6228	48	0	120	0	0	logfile
✘	7TF5	25862	2024-11-19	2022-01-06	3.16	3.97	—	3.4	0.004	0.75	0.0	0.05	13.18	0.01	2.262	3.03	0.37	2.1	97.9	0.0	-0.17	0.86	0.83	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	50298	6228	48	0	120	0	0	logfile
✘	7WiW	32538	2024-11-15	2022-01-05	3.12	3.47	—	3.4	0.006	0.99	1.0	0.05	14.75	0.01	1.891	8.72	1.03	7.1	92.3	0.6	-4.54	0.72	0.89	3.28	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8603	1137	4	0	5	0	0	logfile
✘	7TCP	25816	2024-11-17	2021-12-27	3.84	3.97	—	3.9	0.002	0.37	0.0	0.03	9.57	0.00	2.327	4.21	1.26	2.8	97.2	0.0	2.66	0.70	0.81	2.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14992	1912	12	0	12	0	0	logfile
✘	7Qo1	14080	2024-11-17	2021-12-23	4.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14179	1694	9	62	1	0	0	logfile
✘	7TC0	25803	2024-11-17	2021-12-22	3.1	3.02	2.78	3.2	0.003	0.59	3.0	0.04	15.73	0.01	1.817	8.24	2.49	4.1	95.9	0.0	-1.78	0.74	0.81	1.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13809	1781	4	0	11	0	0	logfile
✘	7QL3	14062	2024-11-14	2021-12-19	3.32	3.47	3.01	3.5	0.011	2.01	8.0	0.11	12.27	0.01	2.489	0.00	0.00	7.7	92.3	0.0	-3.47	0.46	0.82	4.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3246	426	6	0	0	0	0	logfile
✘	7QKS	14050	2024-11-15	2021-12-18	3.1	3.39	3.08	3.3	0.005	0.74	0.0	0.05	14.59	0.01	2.210	4.65	0.10	1.8	98.2	0.0	0.65	0.75	0.87	2.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9339	1199	2	0	1	0	0	logfile
✘	7T9B	25755	2024-11-20	2021-12-18	3.72	4.06	3.76	3.9	0.021	1.77	0.0	0.13	12.57	0.01	2.289	1.04	0.98	3.7	95.6	0.7	0.40	0.81	0.86	2.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21592	2595	42	0	101	0	0	logfile

• ← previous
• Page 22 of 38
• next →