Table showing results for December 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✔	7Z15	14441	2022-12-21	2022-02-24	1.93	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7QV7	14169	2022-12-21	2022-01-19	3.4	4.04	—	3.9	0.003	0.69	1.0	0.05	13.96	0.01	1.097	6.72	0.00	5.4	94.5	0.0	-1.58	0.76	0.71	0.93	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	41236	5276	32	0	58	0	0	logfile
✘	7V2N	31657	2022-12-22	2021-08-09	3.6	3.38	3.41	3.1	0.008	1.21	2.0	0.11	17.76	0.00	2.085	8.75	0.63	7.0	92.7	0.3	-1.20	0.82	0.84	1.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	51020	2626	24	1394	2	0	0	logfile
✘	7SP6	25366	2022-12-18	2021-11-02	3.1	3.58	—	3.5	0.004	0.58	0.0	0.04	14.28	0.00	2.308	5.40	0.00	1.5	98.5	0.0	1.72	0.61	0.75	1.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5957	733	5	0	3	0	0	logfile
✘	7W7F	32343	2022-12-18	2021-12-04	3.35	3.74	—	3.7	0.015	1.01	0.0	0.07	17.19	0.01	2.144	13.79	0.31	8.1	91.6	0.3	-1.42	0.42	0.74	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11987	1424	7	0	29	0	0	logfile
✘	7KSQ	23023	2022-12-19	2020-11-23	2.8	3.19	—	3.1	0.006	1.23	0.0	0.06	17.58	0.05	1.213	8.45	0.00	3.9	96.0	0.1	-3.56	0.67	0.79	3.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	36553	3347	42	0	219	45	0	logfile
✘	7WPB	32681	2022-12-18	2022-01-23	2.79	2.94	—	2.9	0.005	0.73	0.0	0.05	15.18	0.01	2.101	3.78	0.29	3.0	97.0	0.0	-4.67	0.68	0.86	4.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6491	793	2	0	5	0	0	logfile
✘	7KUX	23040	2022-12-19	2020-11-25	2.8	3.21	—	3.2	0.006	1.23	0.0	0.06	17.63	0.05	1.213	8.52	0.00	3.7	96.2	0.1	-3.51	0.63	0.79	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35803	3259	40	0	215	45	0	logfile
✔	7TB8	25794	2022-12-18	2021-12-21	2.83	3.55	2.90	3.1	0.003	0.62	0.0	0.04	13.36	0.00	2.099	7.51	0.03	6.9	92.8	0.3	-1.54	0.82	0.80	2.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	33230	4189	23	0	43	0	0	logfile
✘	7XJi	33228	2022-12-18	2022-04-18	3.9	3.60	3.70	3.9	0.003	0.60	0.0	0.04	13.86	0.00	2.165	9.28	0.00	4.3	95.7	0.0	-0.25	0.61	0.78	2.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7851	1027	6	0	1	0	0	logfile
✘	7WFE	32463	2022-12-19	2021-12-26	3.25	3.37	—	3.3	0.009	1.73	0.0	0.06	18.83	0.02	1.207	6.15	1.38	6.3	93.6	0.1	-3.28	0.68	0.82	3.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35123	3216	30	0	205	0	0	logfile
✘	7PQQ	13596	2022-12-18	2021-09-18	3.3	3.44	—	3.5	0.004	0.69	0.0	0.04	14.02	0.00	2.244	12.20	0.00	4.6	95.4	0.0	-2.50	0.44	0.73	3.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3207	417	2	0	0	0	0	logfile
✘	7Z6H	14527	2022-12-18	2022-03-11	3.59	2.39	3.80	2.2	0.003	0.62	0.0	0.04	19.70	0.01	2.045	8.12	0.68	6.4	93.4	0.2	-0.27	0.74	0.70	1.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20629	2513	15	32	5	0	0	logfile
✘	7ZGP	14710	2022-12-18	2022-04-04	2.7	2.79	2.57	2.8	0.003	0.58	0.0	0.05	14.54	0.00	2.175	10.64	0.96	6.3	93.5	0.2	-0.84	0.79	0.91	5.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14055	1767	6	4	2	0	0	logfile
✘	7TFS	25879	2022-12-18	2022-01-07	4.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13008	1616	8	0	32	0	0	logfile
✘	7MHS	23835	2022-12-18	2021-04-15	3.6	3.95	—	3.9	0.010	0.81	0.0	0.04	15.42	0.03	1.516	7.43	0.00	4.3	95.7	0.0	1.83	0.66	0.79	0.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21148	2652	11	0	48	0	0	logfile
✔	7R5o	14332	2022-12-20	2022-02-11	1.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	38520	4152	72	0	24	3384	0	logfile
✘	7QHM	13976	2022-12-19	2021-12-13	2.8	2.80	—	2.8	0.008	0.94	0.0	0.05	15.82	0.01	1.191	2.01	0.35	4.0	95.8	0.2	-1.90	0.62	0.81	3.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	94633	5886	67	0	88	416	45103	logfile
✘	7SK6	25174	2022-12-18	2021-10-19	4.0	4.42	—	4.1	0.018	1.92	2.0	0.11	13.16	0.01	2.462	0.21	0.76	4.2	94.0	1.8	0.35	0.52	0.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9144	585	4	0	0	0	4462	logfile
✘	7URC	26708	2022-12-18	2022-04-21	3.14	3.74	3.25	3.6	0.017	0.98	0.0	0.88	13.59	0.00	1.182	10.27	0.00	3.5	96.5	0.0	-3.02	0.58	0.86	3.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5561	658	4	0	12	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 443
• next →