Table showing results for December 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6LHU	0899	2022-12-18	2019-12-10	3.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23169	1518	2	0	0	0	11483	logfile
✘	6LMK	0917	2022-12-18	2019-12-26	3.7	3.89	—	3.8	0.009	0.96	0.0	0.06	15.10	0.01	2.283	7.19	0.62	6.5	93.5	0.0	-4.19	0.68	0.82	1.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9240	1178	6	0	0	0	0	logfile
✘	6PW6	20500	2022-12-18	2019-07-22	4.5	4.56	4.36	4.5	0.021	1.78	0.0	0.11	10.80	0.01	2.200	1.86	0.56	2.7	97.2	0.2	0.50	0.74	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15942	1842	45	0	108	0	0	logfile
✔	6U5B	20643	2022-12-19	2019-08-27	3.5	3.46	—	3.4	0.005	0.95	0.0	0.06	10.09	0.01	2.206	5.76	0.17	8.9	91.1	0.0	-5.11	0.63	0.81	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	103392	13608	60	0	0	0	0	logfile
✘	6VFi	21173	2022-12-19	2020-01-05	4.54	4.63	4.54	4.5	0.018	1.47	0.0	0.09	10.93	0.01	2.449	0.53	0.00	1.3	98.7	0.0	1.21	0.74	0.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	60925	7875	50	0	0	0	0	logfile
✘	6LiD	0904	2022-12-18	2019-12-10	2.7	2.74	—	2.7	0.007	0.99	0.0	0.06	14.33	0.01	1.890	3.70	1.96	4.8	95.1	0.1	-4.84	0.62	0.74	3.13	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17964	2162	22	0	26	246	0	logfile
✘	6W5U	21548	2022-12-18	2020-03-13	3.9	3.97	—	3.9	0.011	1.50	4.0	0.16	17.07	0.01	1.741	63.68	6.82	8.5	90.5	1.0	-2.76	0.61	0.76	1.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9474	1175	6	0	21	0	0	logfile
✘	6UTF	20877	2022-12-21	2019-10-29	3.4	4.04	3.76	4.0	0.009	1.28	0.0	0.07	10.41	0.01	2.036	7.47	0.70	5.7	93.9	0.5	-3.27	0.75	0.77	1.47	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	46494	6013	28	0	0	0	0	logfile
✘	6UD3	20731	2022-12-18	2019-09-18	3.5	4.06	3.46	3.8	0.018	1.60	0.0	0.11	11.84	0.01	2.293	7.52	0.00	4.6	95.4	0.0	-1.90	0.79	0.78	1.69	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14346	1765	10	0	6	0	0	logfile
✔	6UQE	20845	2022-12-22	2019-10-18	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48402	6140	28	0	33	0	0	logfile
✘	6X80	22088	2022-12-19	2020-06-01	3.5	3.69	—	3.5	0.006	0.60	0.0	0.04	13.31	0.00	1.254	8.52	0.01	8.5	91.3	0.2	-2.33	0.48	0.90	2.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	97482	12628	44	0	374	0	0	logfile
✔	6W1Z	21519	2022-12-22	2020-03-04	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48536	6156	27	0	36	0	0	logfile
✘	6WBX	21600	2022-12-18	2020-03-27	3.5	3.82	3.55	3.7	0.012	1.07	0.0	0.06	13.49	0.01	2.190	4.07	0.11	7.9	92.0	0.1	-5.51	0.77	0.87	3.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9170	1264	1	0	2	0	0	logfile
✘	6V4D	21040	2022-12-18	2019-11-27	3.8	4.13	—	4.1	0.007	0.90	0.0	0.06	13.63	0.01	1.752	21.75	1.35	7.0	93.0	0.0	-3.84	0.49	0.80	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3095	422	1	0	0	0	0	logfile
✘	7C2K	30275	2022-12-18	2020-05-07	2.93	3.24	3.00	3.1	0.007	0.67	0.0	0.04	13.79	0.00	2.256	7.24	0.00	4.5	95.5	0.0	-2.91	0.78	0.89	4.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10692	1256	7	31	3	0	0	logfile
✘	6XKT	22224	2022-12-18	2020-06-27	3.75	3.88	—	3.8	0.009	0.99	1.0	0.07	13.78	0.01	1.732	26.25	0.08	16.5	83.1	0.4	-4.20	0.75	0.79	2.04	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13079	1678	12	0	8	0	0	logfile
✘	6ZHD	11218	2022-12-18	2020-06-22	3.7	4.31	—	3.8	0.008	1.45	10.0	0.10	12.70	0.01	1.973	5.32	0.74	3.6	96.3	0.0	-0.92	0.89	0.88	2.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26927	3353	29	0	66	0	0	logfile
✘	6YXR	10995	2022-12-19	2020-05-03	3.4	3.53	3.43	3.5	0.019	2.32	2.0	0.14	19.66	0.02	1.197	27.04	0.44	4.1	95.7	0.3	-3.53	0.67	0.76	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31910	2783	20	0	194	0	0	logfile
✘	7LLA	23413	2022-12-18	2021-02-03	2.97	3.51	—	3.4	0.006	0.96	0.0	0.06	14.55	0.01	2.260	6.11	0.59	4.6	95.4	0.0	-2.37	0.74	0.79	2.24	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31900	4084	8	0	12	0	0	logfile
✔	7oJ8	12939	2022-12-18	2021-05-14	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9148	1150	4	0	7	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 443
• next →