Table showing results for May 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7D65	30589	2022-05-15	2020-09-29	2.94	3.09	—	3.2	0.008	0.94	0.0	0.05	16.49	0.01	2.328	1.94	0.14	4.3	95.7	0.0	-7.00	0.66	0.81	2.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26664	3168	22	0	55	0	0	logfile
✘	7D61	30587	2022-05-15	2020-09-28	2.8	2.98	—	3.0	0.003	0.77	0.0	0.04	16.27	0.01	2.340	1.83	0.00	2.4	97.6	0.0	-7.13	0.69	0.82	2.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	26664	3168	22	0	55	0	0	logfile
✘	6YEZ	10798	2022-05-17	2020-03-25	2.7	3.21	2.66	3.1	0.025	2.78	6.0	0.13	20.68	0.01	1.193	31.03	0.64	5.2	94.5	0.3	-1.96	0.77	0.88	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	39226	3438	35	0	244	2	0	logfile
✘	7ASD	11892	2022-05-16	2020-10-27	3.5	3.68	3.48	3.5	0.003	0.64	0.0	0.06	8.91	0.00	2.153	5.28	2.16	2.2	97.8	0.0	0.30	0.81	0.83	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	30296	3664	48	0	72	0	0	logfile
✘	6WJJ	21694	2022-05-12	2020-04-13	3.8	3.85	—	3.8	0.008	1.05	3.0	0.06	10.44	0.01	2.163	4.63	0.89	5.8	94.2	0.0	-3.43	0.74	0.81	2.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	56908	7076	24	0	24	0	0	logfile
✘	6WM2	21847	2022-05-15	2020-04-20	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	73243	9171	56	0	63	0	0	logfile
✘	6PLR	20373	2022-05-13	2019-07-01	3.2	3.44	—	3.4	0.007	0.93	0.0	0.05	8.76	0.01	1.522	4.62	0.00	3.8	96.2	0.0	-4.64	0.64	0.81	4.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14685	1735	15	0	75	0	0	logfile
✘	6PLV	20377	2022-05-13	2019-07-01	3.3	3.42	—	3.4	0.010	1.05	0.0	0.06	9.18	0.01	1.521	4.41	0.00	5.6	94.4	0.0	-5.00	0.68	0.84	4.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14655	1725	15	0	75	0	0	logfile
✘	6L35	0821	2022-05-16	2019-10-09	3.23	3.36	—	3.3	0.007	0.96	0.0	0.06	19.61	0.02	1.217	12.07	6.15	6.6	93.4	0.0	-2.98	0.72	0.86	2.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34822	3260	30	0	205	0	0	logfile
✘	7A5V	11657	2022-05-14	2020-08-22	1.7	1.73	1.69	1.8	0.014	1.59	0.0	0.09	13.54	0.02	0.000	2.47	0.48	2.2	97.8	0.0	-0.05	0.61	0.79	6.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21155	2275	30	0	85	1015	0	logfile
✘	6YEF	10791	2022-05-18	2020-03-24	3.2	3.11	—	3.1	0.007	0.89	1.0	0.04	15.63	0.02	1.232	3.08	1.06	4.2	95.8	0.0	-4.14	0.67	0.77	3.20	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	141837	5351	60	4639	288	0	0	logfile
✘	6oPo	20151	2022-05-14	2019-04-25	3.5	3.84	3.60	3.7	0.022	1.75	0.0	0.10	10.56	0.01	2.392	1.09	0.41	1.8	98.0	0.2	1.10	0.77	0.82	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21441	2565	51	0	93	0	0	logfile
✘	7D0J	30536	2022-05-14	2020-09-10	3.42	3.77	—	3.7	0.011	1.24	0.0	0.09	18.67	0.01	1.058	17.22	0.04	9.4	90.3	0.3	-2.31	0.77	0.79	2.46	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	68860	5923	56	0	453	0	0	logfile
✘	6PLT	20375	2022-05-13	2019-07-01	3.2	3.64	—	3.5	0.009	1.00	0.0	0.06	9.13	0.01	1.522	4.03	0.00	5.6	94.4	0.0	-4.61	0.67	0.83	4.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14445	1725	15	0	60	0	0	logfile
✔	7L5U	23190	2022-05-04	2020-12-22	3.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	250020	31200	120	60	0	0	0	logfile
✘	7DNH	30783	2022-05-14	2020-12-09	3.64	4.22	—	4.2	0.008	1.08	0.0	0.06	15.01	0.01	1.791	6.23	0.78	9.6	90.2	0.2	-4.48	0.39	0.79	2.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21788	2762	7	0	0	0	0	logfile
✔	7L6H	23204	2022-05-05	2020-12-23	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	251400	31020	120	60	0	0	0	logfile
✔	7L6i	23205	2022-05-04	2020-12-23	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	248820	31020	60	0	0	0	0	logfile
✘	7DX4	30895	2022-05-13	2021-01-18	3.6	3.96	—	3.8	0.007	0.99	0.0	0.06	10.06	0.01	0.766	7.28	0.23	6.0	93.7	0.3	-4.20	0.71	0.79	3.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8234	1027	6	0	5	0	0	logfile
✘	7BC5	12139	2022-05-12	2020-12-18	3.1	3.06	3.11	3.1	0.005	1.05	0.0	0.05	15.92	0.01	2.314	7.83	0.76	8.2	91.8	0.0	-5.64	0.23	0.62	0.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	1200	161	1	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 376
• next →