Table showing results for July 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7TCH	25812	2022-07-03	2021-12-23	3.7	3.94	3.73	3.9	0.003	0.57	0.0	0.04	14.70	0.00	1.323	5.79	0.00	8.0	92.0	0.0	0.08	0.71	0.84	1.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9043	1135	6	0	3	0	0	logfile
✘	7QN8	14070	2022-07-04	2021-12-20	3.1	3.39	—	3.2	0.002	0.41	0.0	0.04	8.22	0.00	1.323	4.17	0.34	0.5	99.5	0.0	2.21	0.79	0.86	3.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16755	1992	19	0	32	0	0	logfile
✘	7STK	25431	2022-07-04	2021-11-14	4.0	4.37	—	3.9	0.004	0.59	0.0	0.04	13.68	0.00	2.147	15.63	0.19	7.1	92.5	0.4	-0.96	0.88	0.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13911	1726	4	0	0	0	0	logfile
✘	7Q4o	13811	2022-07-04	2021-11-01	2.1	2.61	2.24	2.3	0.009	1.49	19.0	0.11	15.61	0.01	1.226	5.11	4.50	2.8	97.2	0.0	-0.66	0.81	0.89	4.17	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21212	2516	20	48	5	285	0	logfile
✘	7RWA	24712	2022-07-04	2021-08-19	4.7	5.66	4.89	4.6	0.003	0.89	0.0	0.05	5.84	0.00	1.914	2.65	0.00	5.8	93.7	0.5	-0.12	0.84	0.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16158	3244	10	0	0	0	0	logfile
✘	7QNE	14076	2022-07-04	2021-12-20	2.7	2.57	—	2.7	0.003	0.46	0.0	0.04	9.10	0.00	1.137	5.08	0.25	1.6	98.4	0.0	0.58	0.73	0.88	5.41	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15302	1808	17	0	42	0	0	logfile
✘	7T6B	25712	2022-07-03	2021-12-13	3.19	3.45	—	3.5	0.004	0.75	0.0	0.05	14.32	0.01	1.337	6.80	0.21	4.0	96.0	0.0	-3.82	0.62	0.82	3.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8755	1119	5	0	1	0	0	logfile
✘	7QN5	14067	2022-07-04	2021-12-20	2.5	2.72	—	2.6	0.002	0.51	0.0	0.04	11.91	0.01	1.202	4.21	0.36	1.6	98.4	0.0	1.02	0.75	0.88	4.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16048	1881	25	0	39	174	0	logfile
✘	7Ro5	24588	2022-07-06	2021-07-30	4.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137886	18894	201	0	0	0	0	logfile
✘	7QN9	14071	2022-07-04	2021-12-20	2.9	3.47	—	3.1	0.003	0.59	0.0	0.04	11.35	0.01	1.323	6.50	0.48	2.1	97.9	0.0	0.56	0.78	0.86	4.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15696	1889	19	0	31	0	0	logfile
✘	7RoE	24593	2022-07-06	2021-07-30	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137886	18894	201	0	0	0	0	logfile
✘	7VYQ	32211	2022-07-04	2021-11-15	3.13	3.33	—	3.4	0.002	0.57	0.0	0.04	16.33	0.00	1.209	6.05	0.00	2.8	97.2	0.0	-1.84	0.64	0.89	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	17080	1120	8	0	8	0	8340	logfile
✘	7Ro6	24589	2022-07-06	2021-07-30	4.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137886	18894	201	0	0	0	0	logfile
✘	7RZW	24780	2022-07-04	2021-08-27	3.3	3.02	3.30	3.3	0.005	0.98	0.0	0.06	15.26	0.01	1.216	7.62	0.88	5.8	94.2	0.0	-2.54	0.75	0.75	1.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13616	1723	4	0	2	0	0	logfile
✘	7RoB	24590	2022-07-06	2021-07-30	3.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137886	18894	201	0	0	0	0	logfile
✘	7W77	32341	2022-07-03	2021-12-03	3.3	3.57	—	3.6	0.022	1.01	1.0	0.10	16.25	0.01	1.226	15.55	0.24	7.0	93.0	0.0	-0.15	0.58	0.75	2.30	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12051	1424	7	0	30	0	0	logfile
✘	7M5V	23683	2022-07-04	2021-03-24	2.9	3.76	—	3.2	0.006	0.99	1.0	0.05	13.66	0.00	1.198	4.25	0.12	7.3	92.7	0.0	0.36	0.71	0.80	2.14	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	16295	1046	1	0	24	6	7985	logfile
✘	7W01	32233	2022-07-03	2021-11-17	3.3	3.43	—	3.4	0.011	1.10	1.0	0.06	16.08	0.01	1.717	10.01	0.60	13.3	85.9	0.8	-4.55	0.68	0.86	2.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12724	1598	1	0	7	0	0	logfile
✘	7WSM	32760	2022-07-03	2022-01-30	3.25	3.65	—	3.6	0.006	0.80	0.0	0.04	15.64	0.01	1.202	11.36	0.81	6.5	93.5	0.0	-1.23	0.62	0.82	1.57	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3577	464	3	0	3	0	0	logfile
✘	7WSN	32761	2022-07-03	2022-01-30	3.31	3.62	—	3.6	0.007	0.79	0.0	0.04	16.06	0.01	1.201	12.89	1.08	5.6	94.4	0.0	-0.44	0.51	0.78	1.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	3567	463	3	0	3	0	0	logfile

• ← previous
• Page 5 of 392
• next →