Table showing results for May 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	5X1G	6701	2022-05-12	2017-01-25	4.5	7.89	—	37.0	0.008	1.42	0.0	0.05	10.05	0.01	2.345	27.78	0.00	6.9	93.1	0.0	-2.75	0.00	0.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	155	31	1	0	0	0	0	logfile
✘	6CNo	7539	2022-05-13	2018-03-08	4.7	4.91	—	4.8	0.006	1.03	0.0	0.05	9.24	0.01	1.936	5.70	0.26	3.5	96.5	0.0	-2.70	0.64	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15428	2024	12	0	12	0	0	logfile
✘	6FML	4277	2022-05-17	2018-01-31	4.34	4.43	—	4.3	0.009	1.01	1.0	0.06	16.49	0.01	2.165	5.08	0.13	6.7	93.2	0.1	-3.82	0.86	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43460	4738	27	288	95	0	0	logfile
✘	5W9J	8785	2022-05-16	2017-06-23	4.8	4.91	5.09	4.7	0.013	1.57	0.0	0.07	11.98	0.02	1.881	5.97	0.90	4.0	94.8	1.2	0.53	0.78	0.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32958	4257	12	0	0	0	0	logfile
✘	6P7N	20267	2022-05-17	2019-06-06	4.9	9.02	6.14	4.9	0.002	0.53	0.0	0.04	14.46	0.00	2.152	6.68	1.33	5.6	94.4	0.0	-3.30	0.81	0.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20356	2352	10	52	4	0	0	logfile
✘	6UoX	20834	2022-05-13	2019-10-15	4.02	4.28	—	4.1	0.010	1.17	1.0	0.08	11.80	0.01	2.461	0.89	0.00	8.2	91.8	0.0	-4.01	0.66	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9138	1161	1	0	14	0	0	logfile
✘	6i7T	4428	2022-05-17	2018-11-17	4.61	4.75	4.92	4.6	0.006	1.17	6.0	0.07	13.63	0.01	2.245	7.14	2.54	12.0	87.5	0.4	-4.32	0.74	0.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	37004	4682	16	0	0	0	0	logfile
✘	6CP5	7547	2022-05-13	2018-03-13	4.2	4.19	—	4.2	0.004	0.84	0.0	0.04	10.90	0.00	1.205	24.08	2.24	7.2	92.0	0.8	-4.36	0.50	0.70	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9413	1234	19	0	4	0	0	logfile
✘	5A7U	3079	2022-05-12	2015-07-10	4.8	3.82	—	4.6	0.020	3.41	3.0	0.25	21.78	0.08	2.651	30.77	25.00	24.0	72.0	4.0	-6.05	-0.01	0.31	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	455	27	1	0	1	0	231	logfile
✘	6CRV	7573	2022-05-14	2018-03-19	3.2	3.31	3.17	3.3	0.013	1.07	0.0	0.06	8.91	0.01	2.170	4.43	0.26	4.1	95.9	0.0	-3.09	0.74	0.81	3.13	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21036	2643	6	0	39	0	0	logfile
✘	6DQS	7983	2022-05-17	2018-06-11	4.12	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	139314	8750	8	0	8	0	69639	logfile
✘	6DQJ	7978	2022-05-17	2018-06-11	3.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	138477	8724	8	0	4	0	69265	logfile
✘	6J6N	0691	2022-05-15	2019-01-15	3.86	3.99	—	3.8	0.008	1.02	1.0	0.06	14.52	0.01	1.463	15.68	2.51	5.1	94.2	0.8	-3.41	0.60	0.63	1.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	78937	8982	47	544	14	0	0	logfile
✘	6J6G	0686	2022-05-15	2019-01-15	3.2	3.37	—	3.2	0.007	0.94	0.0	0.06	14.13	0.01	1.463	15.59	3.03	4.6	94.9	0.5	-3.38	0.67	0.71	2.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	79042	8981	47	550	14	0	0	logfile
✔	6V10	21004	2022-05-05	2019-11-19	3.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	250920	31260	120	120	0	0	0	logfile
✘	6CP7	7549	2022-05-13	2018-03-13	4.1	4.11	—	4.1	0.008	1.42	0.0	0.07	13.16	0.01	1.577	14.57	3.98	6.6	92.9	0.5	-4.99	0.50	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9164	1234	16	0	0	0	0	logfile
✘	6UiW	20789	2022-05-15	2019-10-01	2.7	3.37	—	3.1	0.010	0.99	0.0	0.05	14.23	0.01	1.838	6.63	1.10	3.1	96.9	0.0	-3.44	0.71	0.81	4.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	23617	3234	22	0	11	0	0	logfile
✘	5XNL	6741	2022-05-17	2017-05-23	2.7	2.75	—	2.8	0.013	1.56	0.0	0.08	15.89	0.02	1.207	10.24	0.08	2.1	97.9	0.0	-3.12	0.55	0.78	3.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	98986	9364	136	0	490	1076	0	logfile
✘	6iCZ	9645	2022-05-17	2018-09-07	3.0	3.12	—	3.1	0.015	1.44	14.0	0.08	13.29	0.01	1.411	8.40	1.39	5.8	93.4	0.8	-2.81	0.53	0.64	3.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	97900	14175	58	418	19	0	0	logfile
✘	6MiX	9132	2022-05-17	2018-09-20	3.6	4.57	—	14.0	0.007	1.18	0.0	0.07	16.40	0.01	2.212	9.89	2.30	14.6	85.0	0.4	-5.69	-0.03	0.00	0.22	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43120	5348	4	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 376
• next →