Table showing results for September 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7CWT	30487	2021-09-04	2020-08-31	3.7	3.88	—	3.7	0.009	1.17	16.0	0.11	11.07	0.01	1.257	28.05	1.43	6.9	92.5	0.6	-2.94	0.58	0.48	1.06	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	70024	4584	18	0	14	0	34386	logfile
✔	7BK0	12195	2021-09-03	2021-01-14	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	57536	7411	34	0	0	0	0	logfile
✘	7ALN	11818	2021-09-04	2020-10-06	3.77	3.85	—	3.8	0.009	0.95	0.0	0.06	10.60	0.01	1.198	10.38	0.22	4.1	95.8	0.0	-3.95	0.60	0.82	2.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20789	2616	11	0	13	0	0	logfile
✘	7DVQ	30875	2021-09-07	2021-01-14	2.89	3.02	—	3.0	0.021	1.37	11.0	0.11	13.66	0.01	1.987	12.00	3.57	3.7	96.2	0.1	-1.62	0.63	0.81	3.37	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	99906	13326	57	276	17	3	0	logfile
✘	7BL2	12215	2021-09-06	2021-01-18	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7oCD	12804	2021-09-03	2021-04-26	3.5	3.46	—	3.4	0.009	0.89	0.0	0.04	12.47	0.00	2.132	6.95	0.00	5.3	94.7	0.0	0.37	0.71	0.83	3.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13624	1920	10	0	10	0	0	logfile
✘	6ZJi	11234	2021-09-03	2020-06-29	3.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	7EFD	31084	2021-09-04	2021-03-21	1.77	1.79	1.83	1.9	0.034	3.25	60.0	0.10	15.30	0.00	0.000	2.62	2.15	1.7	97.5	0.8	-0.54	0.71	0.78	5.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20020	2400	20	0	20	780	0	logfile
✘	7D5i	30582	2021-09-02	2020-09-26	2.79	2.96	—	3.0	0.005	0.71	0.0	0.04	13.37	0.00	1.220	6.64	0.00	8.3	91.7	0.0	-1.65	0.65	0.88	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6232	793	3	0	3	0	0	logfile
✘	7MKL	23898	2021-09-04	2021-04-24	3.2	2.50	—	2.1	0.004	0.82	0.0	0.06	12.45	0.01	2.162	10.10	0.00	2.9	97.1	0.0	0.35	0.64	0.58	0.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25597	3164	23	0	63	0	0	logfile
✘	7ARH	11882	2021-09-03	2020-10-25	3.3	3.57	—	3.5	0.003	0.70	0.0	0.05	12.25	0.00	2.324	2.92	0.20	3.5	96.5	0.0	-5.69	0.70	0.75	0.94	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9649	1261	7	0	2	0	0	logfile
✘	7E0i	30933	2021-09-02	2021-01-28	3.53	3.56	—	3.5	0.007	1.51	0.0	0.06	18.60	0.02	1.214	10.76	0.78	7.3	92.7	0.0	-4.03	0.57	0.73	2.10	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8033	677	6	0	58	0	0	logfile
✘	6Zoo	11326	2021-09-06	2020-07-07	2.74	2.89	—	2.8	0.024	2.84	1.0	0.10	21.09	0.03	1.195	14.22	0.00	5.1	94.8	0.1	0.57	0.72	0.85	2.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	38506	3339	33	0	245	2	0	logfile
✘	7L20	23121	2021-09-03	2020-12-15	3.15	3.39	—	3.4	0.007	0.86	0.0	0.05	16.21	0.01	0.505	10.94	0.84	7.3	92.2	0.5	-3.38	0.69	0.79	2.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	110234	9454	67	1583	171	0	0	logfile
✘	7M4V	23667	2021-09-06	2021-03-22	2.54	2.36	—	2.4	0.002	0.51	0.0	0.03	14.92	0.00	1.183	2.88	0.00	2.3	97.6	0.2	0.82	0.71	0.79	4.43	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	86404	3128	48	2847	162	802	0	logfile
✘	7L08	23096	2021-09-03	2020-12-11	3.49	3.80	—	3.7	0.005	0.84	0.0	0.05	16.32	0.01	0.654	10.29	0.68	6.6	93.2	0.2	-3.57	0.74	0.78	1.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	168922	14304	103	2528	199	0	0	logfile
✘	7oF6	12871	2021-09-07	2021-05-04	2.6	3.23	2.55	2.9	0.003	0.53	0.0	0.04	14.86	0.01	1.785	4.18	0.01	3.0	97.0	0.0	1.49	0.90	0.89	3.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	100321	8320	61	1519	94	0	0	logfile
✘	7NG8	12309	2021-09-04	2021-02-08	3.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20173	1341	4	0	0	0	9979	logfile
✘	6ZZX	11588	2021-09-03	2020-08-05	2.7	2.80	2.77	2.8	0.024	2.75	0.0	0.12	21.74	0.02	1.178	15.51	0.00	6.0	93.8	0.2	0.75	0.75	0.88	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	56369	4684	68	0	403	99	0	logfile
✘	7M3M	23657	2021-09-25	2021-03-18	2.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	258518	32452	61	0	0	0	0	logfile

• ← previous
• Page 3 of 279
• next →