Table showing results for April 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6WoU	21861	2022-04-28	2020-04-25	3.27	3.59	3.48	3.5	0.008	0.96	6.0	0.05	18.03	0.01	2.069	3.67	1.64	13.3	86.5	0.2	-4.35	0.65	0.72	1.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	245683	16112	12	0	4	0	120439	logfile
✘	7JMF	22392	2022-04-06	2020-07-31	4.5	5.06	—	4.7	0.005	0.98	0.0	0.05	10.23	0.01	1.373	8.03	0.36	11.2	88.6	0.2	-4.91	0.54	0.27	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	6VL6	21231	2022-04-06	2020-01-22	4.6	5.00	4.54	4.6	0.019	1.46	0.0	0.09	11.38	0.01	2.431	0.59	0.00	0.9	99.1	0.0	0.45	0.87	0.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	21504	2640	24	0	0	0	0	logfile
✘	7CF9	30343	2022-04-05	2020-06-24	4.7	4.24	5.21	4.0	0.006	1.23	0.0	0.06	16.02	0.01	1.538	5.45	1.67	6.2	93.7	0.1	-4.86	0.79	0.68	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	116104	14416	12	0	1820	0	0	logfile
✘	6RPo	4979	2022-04-09	2019-05-14	2.39	2.44	—	2.4	0.006	0.92	0.0	0.05	15.02	0.01	2.326	7.31	0.00	3.7	95.8	0.5	-2.67	0.72	0.86	4.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	101400	12060	60	0	0	0	0	logfile
✘	7JSW	22461	2022-04-10	2020-08-16	3.8	4.37	4.17	4.1	0.006	0.94	0.0	0.08	14.63	0.01	2.174	16.23	0.60	14.0	83.9	2.1	-4.68	0.86	0.85	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	144808	5737	54	4655	0	0	0	logfile
✘	6ZMo	11299	2022-04-25	2020-07-03	3.1	3.04	—	2.8	0.009	1.04	0.0	0.06	16.54	0.01	1.993	4.70	0.82	8.2	91.5	0.3	-3.58	0.86	0.84	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	230351	12939	107	5951	264	0	0	logfile
✘	6S6B	10102	2022-04-05	2019-07-02	2.75	3.35	3.07	3.2	0.005	0.76	0.0	0.05	14.62	0.00	1.961	19.06	0.15	15.3	84.3	0.4	-5.13	0.77	0.82	2.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	66914	8194	39	51	1	0	0	logfile
✘	6VFi	21173	2022-04-04	2020-01-05	4.54	4.63	4.96	4.5	0.018	1.47	0.0	0.09	10.93	0.01	2.449	0.53	0.00	1.3	98.7	0.0	1.21	0.80	0.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	58488	7560	48	0	0	0	0	logfile
✔	7LNK	23460	2022-04-28	2021-02-07	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	243540	30600	60	0	0	0	0	logfile
✘	6PW6	20500	2022-04-05	2019-07-22	4.5	4.56	4.36	4.5	0.021	1.78	0.0	0.11	10.80	0.01	2.200	1.61	0.56	2.7	97.2	0.2	0.50	0.74	0.81	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15942	1842	45	0	108	0	0	logfile
✘	6TRA	10557	2022-04-07	2019-12-18	2.85	3.02	—	3.0	0.006	0.84	0.0	0.04	18.74	0.02	1.225	8.48	0.05	4.7	95.3	0.0	-3.41	0.73	0.83	4.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	25197	2283	33	0	134	217	0	logfile
✘	6XZD	10659	2022-04-05	2020-02-04	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XZR	10666	2022-04-05	2020-02-05	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6XQN	22290	2022-04-04	2020-07-09	3.3	3.76	—	3.7	0.005	0.67	1.0	0.04	14.56	0.00	1.922	7.08	2.87	2.5	97.5	0.0	0.13	0.65	0.70	1.45	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9433	1290	10	0	1	0	0	logfile
✘	6VoC	21260	2022-04-19	2020-01-30	3.1	3.49	—	20.0	0.006	0.90	0.0	0.06	8.74	0.01	0.163	464.29	0.00	1.9	98.1	0.0	-1.94	0.19	0.06	0.07	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	214200	28560	180	0	0	0	0	logfile
✘	6KPJ	0748	2022-04-05	2019-08-15	2.56	3.82	—	3.3	0.014	0.91	0.0	0.06	13.08	0.00	1.218	8.38	0.00	6.7	93.3	0.0	-4.33	0.85	0.86	3.83	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62845	3936	24	0	48	0	31225	logfile
✘	7BoX	30135	2022-04-06	2020-03-20	3.8	3.29	—	3.8	0.012	1.46	5.0	0.07	12.93	0.01	2.236	9.50	0.05	8.1	91.5	0.5	-4.94	0.78	0.81	2.90	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18618	2334	12	0	0	0	0	logfile
✘	6PLR	20373	2022-04-05	2019-07-01	3.2	3.44	—	3.4	0.007	0.93	0.0	0.05	8.76	0.01	1.522	4.45	0.00	3.8	96.2	0.0	-4.64	0.64	0.81	4.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14685	1735	15	0	75	0	0	logfile
✘	6PLU	20376	2022-04-05	2019-07-01	3.3	3.44	—	3.4	0.009	0.98	0.0	0.06	8.88	0.01	1.522	5.24	0.00	3.2	96.8	0.0	-4.81	0.66	0.82	4.32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14665	1720	15	0	80	0	0	logfile

• ← previous
• Page 5 of 366
• next →