Table showing results for December 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✔	7MKQ	23903	2022-12-18	2021-04-26	4.8	4.92	—	4.8	0.004	0.91	1.0	0.05	15.07	0.01	2.010	16.97	1.16	7.0	92.6	0.4	-2.42	0.81	0.79	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32822	4182	7	0	3	0	0	logfile
✘	7E0K	30935	2022-12-18	2021-01-28	3.09	2.58	—	3.1	0.011	1.60	0.0	0.08	17.75	0.02	1.210	8.32	0.00	7.2	92.8	0.0	-3.05	0.62	0.82	4.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8044	677	6	0	58	0	0	logfile
✘	7D72	30599	2022-12-19	2020-10-02	3.4	3.58	—	3.5	0.009	1.23	4.0	0.07	17.20	0.01	1.640	10.30	8.56	4.9	94.8	0.2	-2.44	0.74	0.83	2.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35458	4505	27	0	15	6	0	logfile
✘	7MJK	23876	2022-12-19	2021-04-20	2.73	3.61	—	2.9	0.004	0.77	0.0	0.05	12.93	0.01	2.307	3.00	0.00	3.0	97.0	0.0	-0.85	0.86	0.82	2.65	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	34878	4389	30	0	60	0	0	logfile
✘	7M4P	23663	2022-12-22	2021-03-22	2.86	2.57	—	2.7	0.011	1.14	5.0	0.07	14.52	0.01	1.213	5.92	1.93	2.9	97.1	0.0	0.36	0.54	0.72	3.11	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48616	3142	6	0	9	0	24343	logfile
✘	7DWQ	30882	2022-12-18	2021-01-17	3.3	3.86	—	3.7	0.021	1.24	0.0	0.06	19.97	0.01	1.204	14.61	0.00	4.2	95.8	0.0	0.78	0.64	0.80	2.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	19961	1943	18	0	100	0	0	logfile
✘	7D73	30600	2022-12-19	2020-10-02	3.0	2.48	—	2.7	0.011	1.23	7.0	0.07	19.92	0.01	1.302	10.11	10.36	6.3	93.4	0.3	-3.01	0.55	0.71	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35292	4495	24	0	12	0	0	logfile
✘	7ASL	11897	2022-12-18	2020-10-27	4.5	5.02	—	5.1	0.015	1.83	90.0	0.15	16.07	0.01	2.081	24.02	1.04	3.0	97.0	0.0	-4.02	0.46	0.66	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32490	4230	18	0	0	0	0	logfile
✘	6ZY5	11550	2022-12-18	2020-07-30	3.6	3.95	3.56	4.1	0.011	1.17	0.0	0.09	13.75	0.01	2.219	6.20	0.15	1.8	98.2	0.0	-0.64	0.73	0.74	0.88	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13504	1520	8	60	2	0	0	logfile
✘	6Zoo	11326	2022-12-20	2020-07-07	2.74	2.89	—	2.9	0.024	2.70	2.0	0.12	19.36	0.02	1.195	18.80	0.40	5.0	94.9	0.1	0.56	0.72	0.85	2.29	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	38497	3341	33	0	243	2	0	logfile
✘	7RX4	24724	2022-12-18	2021-08-21	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14012	1798	62	0	0	0	0	logfile
✘	7EVZ	31342	2022-12-18	2021-05-24	3.07	3.81	—	3.7	0.004	0.58	0.0	0.04	13.30	0.00	2.160	7.43	0.30	3.2	96.8	0.0	-1.99	0.54	0.75	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9078	1144	6	0	5	0	0	logfile
✘	7AKJ	11813	2022-12-18	2020-10-01	3.8	3.63	—	3.6	0.005	0.83	0.0	0.07	13.19	0.01	2.143	6.11	0.09	2.9	97.1	0.0	-1.03	0.79	0.79	2.53	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31812	3930	30	0	96	0	0	logfile
✔	7Ni5	12351	2022-12-21	2021-02-11	2.78	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	45052	5581	4	0	6	0	0	logfile
✘	7D5i	30582	2022-12-18	2020-09-26	2.79	2.96	—	3.0	0.005	0.71	0.0	0.04	13.37	0.00	1.220	6.64	0.00	8.3	91.7	0.0	-1.65	0.65	0.88	3.61	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6232	793	3	0	3	0	0	logfile
✘	7DXA	30902	2022-12-18	2021-01-18	3.14	2.79	—	3.0	0.020	2.37	2.0	0.14	20.59	0.03	1.222	13.10	10.97	5.8	94.1	0.2	-4.41	0.75	0.83	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	15162	1629	23	0	50	0	0	logfile
✘	7DXH	30909	2022-12-18	2021-01-18	3.14	2.87	—	2.9	0.020	2.46	1.0	0.12	20.97	0.03	1.222	23.06	7.91	6.4	92.6	1.0	-4.83	0.71	0.81	2.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	20054	2150	31	0	69	0	0	logfile
✘	7LiW	23387	2022-12-18	2021-01-28	2.85	3.25	—	3.2	0.009	1.04	2.0	0.06	13.70	0.01	1.182	5.06	0.71	3.3	96.7	0.0	-3.80	0.74	0.87	4.74	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14598	1871	5	0	3	0	0	logfile
✔	7P7E	13236	2022-12-19	2021-07-19	2.7	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	37326	4612	36	0	23	837	0	logfile
✔	7P7C	13235	2022-12-20	2021-07-19	2.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	38320	4717	36	0	25	948	0	logfile

• ← previous
• Page 5 of 443
• next →