Table showing results for May 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✔	7L6B	23201	2022-05-03	2020-12-23	2.54	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	248520	31260	60	0	0	0	0	logfile
✔	6U0V	20610	2022-05-04	2019-08-14	3.02	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	250200	31140	60	0	0	0	0	logfile
✔	5oW6	3855	2022-05-04	2017-08-30	4.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	249780	32040	180	0	0	0	0	logfile
✔	6V1G	21011	2022-05-04	2019-11-20	2.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	249900	31200	120	120	0	0	0	logfile
✔	7LTM	23516	2022-05-04	2021-02-19	2.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	249300	31080	120	60	0	0	0	logfile
✔	7RL1	24513	2022-05-04	2021-07-23	2.71	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	249480	31140	120	120	0	0	0	logfile
✔	7L6i	23205	2022-05-04	2020-12-23	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	248820	31020	60	0	0	0	0	logfile
✔	7L6A	23200	2022-05-04	2020-12-23	2.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	250440	31260	120	60	0	0	0	logfile
✔	5T0C	8333	2022-05-04	2016-08-15	3.8	3.70	—	4.1	0.005	0.94	2.0	0.05	11.94	0.00	0.352	23.88	0.16	8.0	91.2	0.9	-4.16	0.72	0.59	0.31	3.6	0.007	1.07	5.0	0.04	15.25	0.01	1.879	24.45	0.26	6.7	92.9	0.4	-1.42	1.00	0.74	0.68	0.58	155574	19846	78	0	14	0	0	logfile
✔	5T0C	8332	2022-05-04	2016-08-15	3.8	3.87	—	4.0	0.005	0.94	2.0	0.05	11.94	0.00	0.352	23.88	0.16	8.0	91.2	0.9	-4.16	0.66	0.59	0.56	3.7	0.010	1.18	9.0	0.05	16.14	0.01	1.792	25.19	0.15	6.6	93.0	0.4	-1.53	4.52	0.65	0.61	0.45	155574	19846	78	0	14	0	0	logfile
✔	7L5U	23190	2022-05-04	2020-12-22	3.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	250020	31200	120	60	0	0	0	logfile
✔	6V10	21004	2022-05-05	2019-11-19	3.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	250920	31260	120	120	0	0	0	logfile
✔	6V1Z	21020	2022-05-05	2019-11-21	3.58	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	250920	31260	120	120	0	0	0	logfile
✔	3J4P	5681	2022-05-05	2013-09-10	4.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	254580	31020	60	0	180	60	0	logfile
✔	7D4i	30574	2022-05-05	2020-09-24	4.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	253642	28625	86	1671	367	0	0	logfile
✔	7L6H	23204	2022-05-05	2020-12-23	3.0	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	251400	31020	120	60	0	0	0	logfile
✔	7KWZ	23059	2022-05-12	2020-12-02	3.2	3.41	—	3.4	0.006	0.80	0.0	0.05	12.48	0.00	2.271	14.29	0.00	7.3	92.7	0.0	-5.51	0.47	0.81	4.47	3.4	0.015	1.11	1.0	0.05	15.67	0.01	2.157	18.93	0.91	15.3	84.7	0.0	-5.49	1.07	0.50	0.85	4.25	4695	695	5	0	0	0	0	logfile
✔	6XJi	22211	2022-05-12	2020-06-23	4.0	3.66	—	4.0	0.018	1.60	0.0	0.09	11.91	0.01	2.173	4.83	0.72	1.5	98.5	0.0	1.02	0.55	0.61	—	3.8	0.004	0.70	0.0	0.04	16.51	0.01	1.934	12.97	1.24	3.8	96.2	0.0	0.33	1.05	0.66	0.73	—	8754	1082	6	0	4	0	0	logfile
✔	7DHR	30682	2022-05-12	2020-11-17	3.8	3.96	—	3.9	0.004	0.86	0.0	0.05	14.18	0.01	2.329	4.07	0.31	9.1	90.8	0.1	-6.33	0.70	0.77	3.13	3.9	0.003	0.63	0.0	0.04	15.40	0.00	2.217	10.65	0.62	8.0	92.0	0.0	-3.58	0.42	0.70	0.77	2.17	7057	977	5	0	1	0	0	logfile
✔	7LCK	23276	2022-05-12	2021-01-11	3.24	3.84	3.15	3.6	0.008	1.05	4.0	0.07	14.23	0.01	2.160	7.79	1.16	6.7	93.3	0.0	-0.93	0.69	0.79	2.21	3.7	0.003	0.62	0.0	0.04	15.17	0.00	2.228	4.83	0.58	4.1	95.9	0.0	0.64	0.55	0.66	0.79	2.04	3258	390	1	0	1	11	0	logfile

• ← previous
• Page 2 of 376
• next →