Table showing results for April 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6K33	9908	2021-04-01	2019-05-16	2.74	2.88	—	2.8	0.011	1.32	3.0	0.07	20.20	0.01	1.204	12.16	6.41	6.1	93.5	0.5	-4.27	0.75	0.74	2.19	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	137634	12681	112	0	759	21	0	logfile
✘	6LSS	0964	2021-04-02	2020-01-20	3.23	3.30	—	3.2	0.011	1.15	5.0	0.06	16.97	0.03	1.330	4.42	0.86	7.7	92.1	0.2	-4.03	0.79	0.81	2.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	140565	7369	67	3750	250	16	20	logfile
✘	6YXR	10995	2021-04-05	2020-05-03	3.4	3.53	3.43	3.5	0.019	2.28	2.0	0.13	20.87	0.02	1.197	26.90	0.44	4.1	95.7	0.3	-3.53	0.67	0.76	2.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	31910	2783	20	0	194	0	0	logfile
✘	6SL5	10236	2021-04-05	2019-08-18	2.84	2.97	2.83	3.0	0.027	3.07	9.0	0.14	22.49	0.03	1.180	20.69	0.73	7.3	92.0	0.7	-3.12	0.71	0.77	2.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	43789	3744	36	0	292	0	0	logfile
✘	6SAE	10129	2021-04-06	2019-07-16	1.9	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	164640	18360	480	360	600	11040	0	logfile
✘	6EXN	3979	2021-04-02	2017-11-08	3.7	3.81	—	3.7	0.007	1.24	41.0	0.07	13.49	0.01	0.767	12.45	1.33	6.3	93.2	0.5	-2.85	0.56	0.68	1.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	80677	9374	53	480	105	0	0	logfile
✘	7JMG	22393	2021-04-05	2020-07-31	4.5	7.15	—	4.3	0.005	0.93	0.0	0.05	9.82	0.01	1.373	7.33	0.27	10.3	89.6	0.1	-4.77	0.57	0.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	7JMi	22395	2021-04-05	2020-07-31	4.5	6.62	—	4.3	0.004	0.92	0.0	0.05	10.07	0.01	1.373	7.44	0.31	10.5	89.3	0.2	-4.79	0.58	0.34	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	6PV6	20486	2021-04-05	2019-07-19	4.5	5.79	—	3.8	0.006	1.05	0.0	0.05	10.65	0.01	1.373	9.42	0.31	11.0	88.9	0.1	-4.72	0.60	0.40	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	7JMJ	22396	2021-04-05	2020-07-31	4.5	5.51	—	4.3	0.007	1.08	0.0	0.05	10.58	0.01	1.373	9.84	0.62	11.3	88.5	0.3	-4.67	0.56	0.32	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	120756	13500	12	0	3608	0	0	logfile
✘	6VAF	21139	2021-04-02	2019-12-17	3.9	4.03	—	4.0	0.014	1.95	3.0	0.08	18.58	0.01	2.074	4.37	0.54	8.9	90.7	0.4	-3.45	0.73	0.75	0.99	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	41243	2429	5	58	0	0	20677	logfile
✘	6KiG	9995	2021-04-02	2019-07-18	2.9	2.98	—	2.9	0.007	1.00	0.0	0.06	20.59	0.03	1.361	8.20	0.03	2.9	97.1	0.0	-2.57	0.69	0.74	2.49	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	143022	12888	108	0	846	54	0	logfile
✘	6KiF	9994	2021-04-02	2019-07-18	3.3	3.42	—	3.3	0.008	1.06	0.0	0.06	20.19	0.03	1.354	9.03	0.03	2.9	97.1	0.0	-2.65	0.72	0.74	2.52	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	144312	13395	114	0	843	54	0	logfile
✘	6QC4	4496	2021-04-03	2018-12-26	4.6	4.73	4.64	4.6	0.006	1.12	0.0	0.85	11.07	0.01	1.228	7.30	0.38	10.8	89.0	0.1	-3.76	0.73	0.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	96705	12008	81	0	85	0	0	logfile
✘	5MM2	3528	2021-04-01	2016-12-08	2.7	12.53	1.51	—	0.011	1.29	0.0	0.07	10.78	0.01	1.325	19.49	0.54	12.1	87.0	0.8	-3.96	-0.08	-0.03	0.63	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	6605	854	3	0	0	0	0	logfile
✘	6QC3	4495	2021-04-03	2018-12-26	4.2	4.28	4.21	4.2	0.010	1.33	1.0	0.85	11.92	0.01	1.224	8.13	0.75	11.7	88.1	0.1	-3.94	0.67	0.75	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	96897	12010	84	0	77	0	0	logfile
✘	6REY	4860	2021-04-01	2019-04-12	3.0	3.50	—	3.4	0.009	1.02	2.0	0.06	9.91	0.01	1.394	4.51	0.71	6.9	93.0	0.1	-4.99	0.76	0.87	4.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	70722	9562	32	0	4	0	0	logfile
✘	6YLF	10837	2021-04-02	2020-04-07	4.2	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	6TNU	10537	2021-04-06	2019-12-10	3.1	3.21	—	3.0	0.009	0.94	0.0	0.05	16.91	0.01	1.177	6.91	0.10	10.0	89.9	0.1	-4.10	0.87	0.84	2.23	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	204962	11498	91	5391	9	0	0	logfile
✘	6ZTL	11419	2021-04-07	2020-07-20	3.5	3.59	3.62	3.5	0.013	0.98	0.0	0.05	16.34	0.02	0.185	14.00	8.89	7.5	92.2	0.3	-3.13	0.82	0.84	1.35	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	173036	8895	76	4799	444	0	28	logfile

• ← previous
• Page 2 of 238
• next →