Table showing results for June 2021

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	6QLE	4580	2021-06-02	2019-01-31	3.55	3.69	—	3.6	0.005	0.84	0.0	0.05	14.61	0.01	2.282	3.37	0.27	5.4	94.6	0.1	-3.18	0.73	0.77	1.76	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	18162	2350	11	0	65	0	0	logfile
✘	6SG9	10175	2021-06-04	2019-08-03	3.1	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	104694	11989	60	146	837	3	0	logfile
✘	2XEA	1730	2021-06-05	2010-05-12	4.6	4.10	—	4.2	0.012	2.14	0.0	0.12	20.46	0.02	1.226	159.82	3.68	8.6	90.1	1.3	-3.51	0.39	0.42	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	62671	7546	98	147	0	0	0	logfile
✘	5iMQ	6584	2021-06-05	2016-03-06	3.8	3.95	—	3.9	0.012	1.41	0.0	0.07	20.60	0.01	1.006	62.47	4.55	16.6	72.8	10.6	-4.61	0.71	0.65	0.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	153046	6640	56	4680	1	0	0	logfile
✘	6PP5	20419	2021-06-04	2019-07-05	3.98	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32118	2063	13	0	18	0	16112	logfile
✘	6P9X	20277	2021-06-01	2019-06-10	2.91	3.05	2.91	3.1	0.004	0.57	0.0	0.04	12.46	0.00	2.211	5.37	0.23	2.1	97.9	0.0	-3.97	0.64	0.82	4.18	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8177	1015	9	0	0	17	0	logfile
✘	6GQV	0049	2021-06-02	2018-06-08	4.0	4.12	—	4.0	0.006	1.18	3.0	0.06	17.73	0.01	1.224	8.03	1.11	15.9	83.5	0.6	-5.63	0.83	0.77	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	212058	12368	93	5361	9	0	0	logfile
✘	6MHZ	9124	2021-06-01	2018-09-18	4.1	4.03	—	4.0	0.007	1.18	0.0	0.06	11.43	0.01	1.258	9.12	0.39	10.0	89.9	0.1	-4.72	0.50	0.67	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7112	908	6	0	2	0	0	logfile
✘	6PP7	20421	2021-06-04	2019-07-05	4.05	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	32499	2081	13	0	25	0	16296	logfile
✘	6QCM	4508	2021-06-05	2018-12-28	4.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	logfile
✘	5WP9	8874	2021-06-05	2017-08-03	4.22	4.31	2.20	5.2	0.011	1.22	0.0	0.05	9.98	0.02	1.259	2.07	0.63	5.5	93.1	1.4	-0.58	0.51	0.64	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	117048	7352	24	0	16	0	59080	logfile
✘	6RBE	4794	2021-06-02	2019-04-10	3.8	4.03	3.73	40.0	0.007	1.27	0.0	0.06	18.44	0.01	2.076	9.09	1.35	11.9	86.8	1.2	-4.17	0.25	0.03	0.00	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	72721	4512	33	1750	0	0	0	logfile
✘	6N26	9324	2021-06-02	2018-11-12	3.0	3.29	—	3.2	0.008	0.83	0.0	0.05	9.20	0.01	2.277	2.55	0.00	3.2	96.8	0.0	-6.12	0.72	0.83	4.16	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	13190	1595	5	0	0	0	0	logfile
✘	6RX4	10049	2021-06-01	2019-06-07	3.3	3.78	3.21	3.8	0.007	1.07	0.0	0.06	10.57	0.01	1.205	5.39	0.14	4.5	95.5	0.0	-4.07	0.67	0.80	2.95	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	7347	884	8	0	31	7	0	logfile
✘	6HWH	0289	2021-06-04	2018-10-12	3.3	3.56	—	3.5	0.013	2.17	1.0	0.20	12.78	0.01	0.691	7.65	0.51	9.4	90.5	0.1	-5.53	0.71	0.81	4.01	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	40632	4916	40	0	420	0	0	logfile
✘	5LZZ	4137	2021-06-05	2016-10-02	3.47	3.60	3.52	3.5	0.008	1.25	7.0	0.10	18.41	0.01	1.247	3.46	7.70	7.5	91.8	0.7	-4.03	0.80	0.88	2.50	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	222005	12497	107	5671	273	0	0	logfile
✘	6Jo6	9854	2021-06-05	2019-03-20	2.9	2.92	—	2.9	0.027	2.67	0.0	0.09	18.95	0.02	1.209	7.96	0.55	4.2	95.8	0.1	-2.50	0.79	0.85	4.21	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	45099	3899	36	0	285	0	0	logfile
✘	6XYQ	10652	2021-06-01	2020-01-30	3.09	3.30	2.79	3.3	0.007	0.71	0.0	0.05	12.97	0.00	2.130	9.08	0.00	3.5	96.5	0.0	-4.52	0.46	0.84	3.97	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	4955	725	10	0	0	0	0	logfile
✘	6E10	8951	2021-06-05	2018-07-08	4.16	4.27	—	4.2	0.008	1.16	11.0	0.07	10.73	0.01	1.063	10.25	1.07	5.8	93.8	0.4	-4.45	0.79	0.72	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	57352	6823	34	0	359	0	0	logfile
✘	5XTD	6773	2021-06-01	2017-06-19	3.7	3.83	—	3.7	0.012	1.59	1.0	0.14	10.06	0.01	1.049	27.50	0.83	6.5	90.6	2.9	-1.69	0.75	0.72	2.51	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	66789	8191	62	0	30	0	0	logfile

• ← previous
• Page 2 of 253
• next →