Table showing results for April 2022

The table shows a selection of parameters. Activate more columns using the drop-down menus below.
peach highlight: initial model; blue highlight: re-refined model

Resolution

• Resolution
• D₉₉
• D_FSC
• D_Model
• D_Model refined

Map vs model

• CC_box
• CC_mask
• EMRinger
• CC_box refined
• CC_mask refined
• EMRinger refined

Geometry

• Bond rmsd
• Angle rmsd
• Cβ devts
• Chirality
• Dihedral rmsd
• Plane rmsd
• Min nonbonded
• Clashscore
• Rota outliers
• Bond rmsd refined
• Angle rmsd refined
• Cβ devts refined
• Chirality refined
• Dihedral rmsd refined
• Plane rmsd refined
• Min nonbonded refined
• Clashscore refined
• Rota outliers refined
• RMSD

Ramachandran

• Rama allowed
• Rama favored
• Rama outliers
• Z-score
• Rama allowed refined
• Rama favored refined
• Rama outliers refined
• Z-score refined

Composition

• # atoms
• # residues
• # chains
• # nucleotides
• # other
• # water
• # H

Other

• Date processed
• Release Date

Table content is loading...

Status	PDB code	EMDB code	Date processed	Release Date	Resolution	D99	DFSC	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	CCbox	CCmask	EMRinger	DModel	Bond rmsd	Angle rmsd	Cβ devts	Chirality	Dihedral rmsd	Plane rmsd	Min nonbonded	Clashscore	Rota outliers	Rama allowed	Rama favored	Rama outliers	Z-score	RMSD	CCbox	CCmask	EMRinger	# atoms	# residues	# chains	# nucleotides	# other	# water	# H	Logfile
✘	7MD2	23763	2022-04-06	2021-04-03	3.1	2.24	3.15	2.2	0.009	0.77	0.0	0.05	13.99	0.00	1.190	3.12	0.25	1.8	98.0	0.2	-1.87	0.73	0.76	3.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	47119	3115	13	0	8	0	23645	logfile
✘	7BGi	12180	2022-04-10	2021-01-07	2.54	2.63	2.58	2.6	0.025	2.67	0.0	0.13	19.97	0.02	1.195	8.36	0.00	3.1	96.9	0.1	-0.25	0.68	0.86	4.25	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	52213	4370	59	0	354	337	0	logfile
✘	7NYU	12654	2022-04-08	2021-03-23	3.8	3.88	4.17	3.9	0.005	0.86	0.0	0.05	13.98	0.01	2.097	4.69	0.82	3.3	96.7	0.0	-1.67	0.52	0.59	0.84	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	35228	4618	18	0	11	0	0	logfile
✘	7CXR	30495	2022-04-04	2020-09-02	3.4	3.32	3.43	3.7	0.007	0.87	1.0	0.06	16.56	0.00	2.199	12.79	3.39	6.6	93.1	0.3	-2.27	0.52	0.54	1.33	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	5168	614	2	0	0	0	0	logfile
✘	7CUB	30471	2022-04-05	2020-08-22	2.55	2.79	—	2.7	0.008	0.85	0.0	0.05	14.60	0.01	1.245	4.03	4.63	3.8	95.9	0.3	-3.84	0.73	0.89	4.60	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9842	1199	7	0	9	13	0	logfile
✘	7PHP	13424	2022-04-04	2021-08-18	3.47	3.48	—	3.6	0.017	0.90	0.0	0.05	14.25	0.01	2.182	6.55	0.11	7.0	93.0	0.0	-1.50	0.72	0.83	3.15	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	8647	1134	8	0	0	21	0	logfile
✘	7RX4	24724	2022-04-05	2021-08-21	3.8	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	14012	1798	62	0	0	0	0	logfile
✘	7RX5	24725	2022-04-04	2021-08-21	3.4	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9348	1189	41	0	0	0	0	logfile
✘	7RYP	24744	2022-04-05	2021-08-25	4.8	5.38	4.84	6.5	0.015	1.50	0.0	0.07	10.94	0.01	2.098	4.80	0.00	6.2	92.1	1.7	-1.44	0.78	0.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	11293	725	2	0	0	0	5599	logfile
✘	7RJE	24486	2022-04-04	2021-07-20	3.3	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	57232	3818	24	0	10	0	27924	logfile
✘	6ZZX	11588	2022-04-04	2020-08-05	2.7	2.80	2.77	2.8	0.024	2.69	0.0	0.12	21.02	0.01	1.178	15.55	0.00	6.0	93.8	0.2	0.75	0.75	0.88	3.89	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	56369	4684	68	0	403	99	0	logfile
✘	7oY8	13110	2022-04-06	2021-06-23	2.5	2.51	—	2.6	0.008	0.91	0.0	0.05	15.06	0.01	1.197	0.65	0.21	2.4	97.6	0.0	0.49	0.72	0.78	2.62	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	22902	2293	103	0	68	372	0	logfile
✘	7BKD	12210	2022-04-07	2021-01-15	3.0	2.42	—	2.5	0.006	0.83	6.0	0.06	14.30	0.01	2.118	9.40	1.26	5.5	94.5	0.1	-0.29	0.60	0.80	3.82	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	24799	3177	18	0	26	0	0	logfile
✘	7EVZ	31342	2022-04-05	2021-05-24	3.07	3.81	—	3.7	0.004	0.61	0.0	0.04	13.17	0.00	2.160	7.10	0.30	3.2	96.8	0.0	-1.99	0.54	0.75	1.86	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	9078	1144	6	0	5	0	0	logfile
✘	7BKB	12206	2022-04-05	2021-01-15	3.5	3.74	—	3.7	0.012	1.14	48.0	0.10	15.35	0.01	1.954	10.82	3.80	7.7	92.1	0.2	-1.67	0.53	0.64	0.59	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	64126	8220	44	0	68	0	0	logfile
✘	7F0J	31399	2022-04-05	2021-06-04	2.9	2.91	2.89	2.9	0.002	0.54	0.0	0.04	13.59	0.01	2.281	9.77	0.00	6.3	93.7	0.0	0.67	0.59	0.73	1.26	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	12424	1544	8	0	4	0	0	logfile
✘	7o37	12702	2022-04-09	2021-04-01	3.2	3.13	—	3.1	0.006	1.01	0.0	0.06	15.01	0.01	1.201	5.27	0.04	3.7	96.3	0.0	-1.41	0.90	0.87	2.73	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	48610	5970	52	0	43	0	0	logfile
✘	7BKC	12209	2022-04-05	2021-01-15	3.0	2.63	—	2.7	0.012	1.12	47.0	0.10	15.19	0.01	1.955	10.38	3.41	7.8	92.1	0.1	-1.69	0.62	0.80	3.56	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	64126	8220	48	0	68	0	0	logfile
✘	7PM0	13508	2022-04-05	2021-09-01	3.6	3.89	3.65	3.6	0.005	0.83	0.0	0.05	14.98	0.01	1.200	4.90	0.00	0.2	99.8	0.0	-1.27	0.90	0.85	2.96	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10169	1261	3	0	4	0	0	logfile
✘	7PLY	13506	2022-04-05	2021-09-01	3.2	3.79	3.36	3.5	0.010	0.94	0.0	0.06	14.60	0.01	1.199	3.82	0.00	0.2	99.8	0.0	-1.06	0.89	0.85	2.92	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	—	10149	1258	4	0	4	0	0	logfile

• ← previous
• Page 4 of 366
• next →